Discovering Gavialis gangeticus selenoproteins

Group components: Toni de Dios, Marc Gordo, Anna Llopart, Xavier Martí
Resum Introducció Materials i Mètodes Resultats Discussió Conclusions Referències Agraïments

Selenoproteïnes

Maquinària

Homòlegs de Cys

 

Anàlisi de Selenoproteïnes

DI1

Comparat amb Gallus gallus

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN323949.1 65% 420389 425977 3e-34 Estructura Seqüència

DI2

Comparat amb Gallus gallus

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN327708.1 90% 21508 33230 e-112 Structure Sequence

DI3

Comparat amb Homo sapiens

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN334575.1 60% 37015 102707 8e-90 Estructura Seqüència

GPx1

Comparat amb Homo sapiens

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN325303.1 52% 24515 30340 2e-54 Estructura Seqüència

GPx2

Comparat amb Homo sapiens

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN332733.1 72% 34981 37356 2e-54 Estructura Seqüència

GPx3

Comparat amb Homo sapiens

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN325192.1 53% 11948 38921 3e-28 Estructura Seqüència


Sel15

Comparat amb Homo sapiens

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN331551.1 82% 83143 130918 5e-19 Estructura Seqüència

SelH

Comparat amb Homo sapiens

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN331620.1 63% 17064 18112 3e-11 Estructura Seqüència

SelI

Comparat amb Gallus gallus

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN340711.1 64% 5267 17947 2e-37 Estructura Seqüència

SelK

Comparat amb Gallus gallus

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN339408.1 80% 2714 5998 4e-6 Estructura Seqüència

SelM

Comparat amb Homo sapiens

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN357775.1 73% 208 5648 4e-13 Estructura Seqüència

SelN

Comparat amb Gallus gallus

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN340252.1 86% 93464 108939 7e-33 Estructura Seqüència

SelO

Comparat amb Homo sapiens

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN323317.1 62% 189095 198355 e-28 Estructura Seqüència

SelP

Comparat amb Gallus gallus

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN331503.1 80% 30419 37131 2e-28 Estructura Seqüència

SelR1

Comparat amb Gallus gallus

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN328135.1 62% 9859 54028 2e-41 Estructura Seqüència

SelS

Comparat amb Gallus gallus

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN343631.1 53% 174094 180838 e-7 Estructura Seqüència

SelT

Comparat amb Gallus gallus

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN332697.1 87% 25580 33612 8e-21 Estructura Seqüència

SelU1

Comparat amb Homo sapiens

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN328551.1 75% 84072 92083 9e-20 Estructura Seqüència

SPS2

Comparat amb Homo sapiens

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN325147.1 85% 4433 26094 2e-31 Estructura Seqüència

TR1

Comparat amb Homo sapiens

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN333725.1 70% 102597 152094 2e-17 Estructura Seqüència

TR2

Comparat amb Gallus gallus

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN346354.1 63% 4231 54706 2e-23 Estructura Seqüència

TR3

Comparat amb Gallus gallus

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN347796.1 67% 57360 89451 2e-54 Estructura Seqüència



Anàlisi de Maquinària

eEFsec

Comparat amb Gallus gallus

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN328583.1 89% 1657 50943 e-127

EIF4A3

Comparat amb Homo sapiens

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN353580.1 97% 9377 23227 e-36

MsrA

Comparat amb Gallus gallus

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN339230.1 87% 43319 75367 2e-27

PSTK

Comparat amb Gallus gallus

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN326215.1 57% 25987 30084 6e-16

RPL30

Comparat amb Homo sapiens

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN359763.1 100% 9571 10617 3e-23

SARS2

Comparat amb Homo sapiens

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN325240.1 87% 3729 18387 7e-11

SBP2

Comparat amb Gallus gallus

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN340409.1 67% 2 24336 2e-76

SECp43

Comparat amb Homo sapiens

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN351604.1 73% 9110 85237 2e-09

SecS

Comparat amb Gallus gallus

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN341850.1 98% 10684 59440 2e-42

SEPSECS

Comparat amb Homo sapiens

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN341850.1 94% 10486 59440 6e-41

SPS1

Comparat amb Homo sapiens

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN331553.1 98% 172655 201393 5e-38



Anàlisi d'Homòlegs de Cisteïna

CELF1

Comparat amb Homo sapiens

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN326986.1. 78% 67322 148262 8e-26 Estructura Seqüència

ELAVL1

Comparat amb Homo sapiens

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN326208.1 100% 2342 100675 2e-66 Estructura Seqüència

G6PD

Comparat amb Homo sapiens

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN354991.1 83% 29 3675 6e-56

GPx4

Comparat amb Homo sapiens

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN350882.1 72% 167048 178702 4e-18

GPx7

Comparat amb Gallus gallus

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN343115.1 87% 4518 8341 e-41

GPx8

Comparat amb Gallus gallus

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN325713.1 90% 105789 108921 4e-48 Estructura Seqüència

SCLY

Comparat amb Homo sapiens

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN338129.1 60% 55102 71706 8e-19 Estructura Seqüència

SelR2

Comparat amb Homo sapiens

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN335858.1 67% 27975 56239 4e-15

SelR3

Comparat amb Homo sapiens

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN328135.1 58% 18890 54034 e-36 Estructura Seqüència

SelU2

Comparat amb Homo sapiens

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN342762.1 73% 15913 20632 2e-16

SelU3

Comparat amb Homo sapiens

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN328749.1 52% 177079 233872 3e-11

TTPA

Comparat amb Homo sapiens

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN350030.1 46% 193583 200940 2e-12

XPO1

Comparat amb Homo sapiens

BLAST EXONERATE PROTEÏNA PREDITA T-COFFEE SECIS
Scaffold Identitat Posició inicial Posició final E-value
KN325182.1 67% 72686 123403 4e-38