http://community.batmanarkhamcity.com/content/images/legal/batman_logo_legal.png






Resultats

Huertas J, Iglesias E, Jané P, Jurado P, Puig T




Selenoproteïnes:

A continuació exposem els resultats obtinguts. A la taula hi trobem dos colors: per una banda groc, que mostra les querys que s'han extret d'Homo sapiens i per una altra banda verd, que fa referència a les querys utilitzades de Myotis lucifugus de la base de dades Selenodb.

Proteïna Proteïna Homo sapiens Proteïna Myotis lucifugus Proteïna Myotis davidii Scaffold Exonerate Genewise Tcoffee SECIS Seblastian
Escrit Imatge
Sel15 Se-Cys Se-Cys Se-Cys KB105184.1
GPx1 Se-Cys Cys ????? KB112367.1
GPx2 Se-Cys Se-Cys Se-Cys KB104801.1
GPx3 Se-Cys Se-Cys Se-Cys KB109247.1
GPx4 Se-Cys Se-Cys Se-Cys KB108036.1
GPx5 Cys Cys Cys KB101385.1
GPx6 Se-Cys - -
GPx7 Cys Cys Cys KB110890.1
GPx8 Cys - Cys KB105949.1
DI1 Se-Cys Se-Cys Se-Cys KB110890.1
DI2 Se-Cys Se-Cys Se-Cys KB199564.1
DI3 Se-Cys - Se-Cys KB109558.1
MsrA Cys Cys Cys KB115814.1
SelH Se-Cys Se-Cys Se-Cys KB113170.1
SelI Se-Cys Se-Cys Se-Cys KB110330.1
SelK+ Se-Cys Se-Cys se-Cys KB114370.1
SelK- Se-Cys Se-Cys Se-Cys KB100898.1
SelM Se-Cys Cys -
SelN Se-Cys Se-Cys Se-Cys KB168745.1
SelO Se-Cys Se-Cys Se-Cys KB112774.1
SelP Se-Cys Se-Cys Se-Cys KB115516.1
SelR1 Se-Cys Se-Cys Se-Cys KB107323.1
SelR2 Cys - -
SelR3 Cys Cys Cys KB111605.1
SelS Se-Cys - Se-Cys KB112968.1
SelT Se-Cys - Se-Cys KB114215.1
SelU1 Cys Cys Cys KB101389.1
SelU2 Cys - -
SelU3 Cys - -
SelV Se-Cys - -
SelW1 Se-Cys Se-Cys Se-Cys KB100806.1
SelW2 Cys - Cys KB115179.1
TR1 Se-Cys Se-Cys Se-Cys KB111329.1
TR2 Se-Cys Se-Cys Se-Cys KB111160.1
TR3 Se-Cys Se-Cys -

Maquinària:

D'altra banda, la taula següent mostra els resultats obtinguts en la cerca de la maquinària de síntesi de les selenoproteïnes en el genoma tant de Myotis lucifugus com d'Homo sapiens realitzada de forma manual:

Proteïna Proteïna Homo sapiens Proteïna Myotis lucifugus Proteïna Myotis davidii Scaffold Exonerate Genewise Tcoffee SECIS Seblastian
Escrit Imatge
eEFSec Cys Cys Cys KB106856.1
Pstk Cys Cys Cys KB101169.1
SBP2 Cys Cys Cys KB099365.1
Secp43 Cys Cys Cys KB116655.1
SecS Cys Cys Cys KB112772.1
SPS1 Cys - Cys KB116581.1
SPS2 Se-Cys - Se-Cys KB189536.1

Pots trobar totes les proteïnes predites en Myotis davidii aquí. Pots trobar tots els elements SECIS predits en Myotis davidii aquí.