Selenoproteïnes:
A continuació exposem els resultats obtinguts. A la taula hi trobem dos colors: per una banda groc, que mostra les querys que s'han extret d'Homo sapiens i per una altra banda verd, que fa referència a les querys utilitzades de Myotis lucifugus de la base de dades Selenodb.
Proteïna | Proteïna Homo sapiens | Proteïna Myotis lucifugus | Proteïna Myotis davidii | Scaffold | Exonerate | Genewise | Tcoffee | SECIS | Seblastian | |
Escrit | Imatge | |||||||||
Sel15 | Se-Cys | Se-Cys | Se-Cys | KB105184.1 | ||||||
GPx1 | Se-Cys | Cys | ????? | KB112367.1 | ||||||
GPx2 | Se-Cys | Se-Cys | Se-Cys | KB104801.1 | ||||||
GPx3 | Se-Cys | Se-Cys | Se-Cys | KB109247.1 | ||||||
GPx4 | Se-Cys | Se-Cys | Se-Cys | KB108036.1 | ||||||
GPx5 | Cys | Cys | Cys | KB101385.1 | GPx6 | Se-Cys | - | - | ||
GPx7 | Cys | Cys | Cys | KB110890.1 | ||||||
GPx8 | Cys | - | Cys | KB105949.1 | ||||||
DI1 | Se-Cys | Se-Cys | Se-Cys | KB110890.1 | ||||||
DI2 | Se-Cys | Se-Cys | Se-Cys | KB199564.1 | ||||||
DI3 | Se-Cys | - | Se-Cys | KB109558.1 | ||||||
MsrA | Cys | Cys | Cys | KB115814.1 | ||||||
SelH | Se-Cys | Se-Cys | Se-Cys | KB113170.1 | ||||||
SelI | Se-Cys | Se-Cys | Se-Cys | KB110330.1 | ||||||
SelK+ | Se-Cys | Se-Cys | se-Cys | KB114370.1 | ||||||
SelK- | Se-Cys | Se-Cys | Se-Cys | KB100898.1 | ||||||
SelM | Se-Cys | Cys | - | |||||||
SelN | Se-Cys | Se-Cys | Se-Cys | KB168745.1 | ||||||
SelO | Se-Cys | Se-Cys | Se-Cys | KB112774.1 | ||||||
SelP | Se-Cys | Se-Cys | Se-Cys | KB115516.1 | ||||||
SelR1 | Se-Cys | Se-Cys | Se-Cys | KB107323.1 | ||||||
SelR2 | Cys | - | - | |||||||
SelR3 | Cys | Cys | Cys | KB111605.1 | ||||||
SelS | Se-Cys | - | Se-Cys | KB112968.1 | ||||||
SelT | Se-Cys | - | Se-Cys | KB114215.1 | ||||||
SelU1 | Cys | Cys | Cys | KB101389.1 | ||||||
SelU2 | Cys | - | - | |||||||
SelU3 | Cys | - | - | |||||||
SelV | Se-Cys | - | - | |||||||
SelW1 | Se-Cys | Se-Cys | Se-Cys | KB100806.1 | ||||||
SelW2 | Cys | - | Cys | KB115179.1 | ||||||
TR1 | Se-Cys | Se-Cys | Se-Cys | KB111329.1 | ||||||
TR2 | Se-Cys | Se-Cys | Se-Cys | KB111160.1 | ||||||
TR3 | Se-Cys | Se-Cys | - |
Maquinària:
D'altra banda, la taula següent mostra els resultats obtinguts en la cerca de la maquinària de síntesi de les selenoproteïnes en el genoma tant de Myotis lucifugus com d'Homo sapiens realitzada de forma manual:
Proteïna | Proteïna Homo sapiens | Proteïna Myotis lucifugus | Proteïna Myotis davidii | Scaffold | Exonerate | Genewise | Tcoffee | SECIS | Seblastian | |
Escrit | Imatge | |||||||||
eEFSec | Cys | Cys | Cys | KB106856.1 | ||||||
Pstk | Cys | Cys | Cys | KB101169.1 | ||||||
SBP2 | Cys | Cys | Cys | KB099365.1 | ||||||
Secp43 | Cys | Cys | Cys | KB116655.1 | ||||||
SecS | Cys | Cys | Cys | KB112772.1 | ||||||
SPS1 | Cys | - | Cys | KB116581.1 | ||||||
SPS2 | Se-Cys | - | Se-Cys | KB189536.1 |
Pots trobar totes les proteïnes predites en Myotis davidii aquí. Pots trobar tots els elements SECIS predits en Myotis davidii aquí.