Discussió

Huertas J, Iglesias E, Jané P, Jurado P, Puig T




Phosphoseryl-tRNA kinase (Pstk)

Pstk és una proteïna de maquinària que es troba anotada a selenoDB per a Myotis lucifugus, però degut a que la seq¨ència no comença per metionina (M), l'hem descartat i hem utilitzat la query de la proteïna de Homo sapiens.

El blast ens dóna un sol hit, en el sentit contrari a l'anotació (-) amb una alta homologia amb la query i una puntuació elevada de tcoffee. Aquest scaffold, on es troba Pstk es KB101169.1.

L'exonerate ha predit una sola proteïna amb 4 exons i 3 introns, i una raw score de 708. Pel que fa al genewise, també ha predit només una proteïna que conté 4 exons i 3 introns, amb un score de 287.91 bits.

Al ser una proteïna de maquinària, no conté selenocisteïnes en la seva seq¨ència, no trobem estructures SECIS ni predim cap proteïna amb el Seblastian.

Tenint com a referència l'alta puntuaciĆ³ del tcoffee, i l'alta homologia observada en l'exonerate i el genewise, podem hipotetitzar que la estructura està ben conservada.