Recerca de selenoproteïnes en protistes:
SelW,MsrA
Carlevaro J.; Casas A.; Eraso A.; Farrés A.; Gamallo B.
Taula MsrA
Per veure la discussió de cada organisme, cliqueu sobre la casella de la taula corresponent.
Per buscar proteïnes de la família de SelW hem utilitzat 8 queries diferents de varis organismes. En l'anàlisi hem comparat totes les queries contra cada un dels genomes. En les taules, però, per a cada genoma només es mostra el resultat fruit de comparar una sola query.
Això es deu a què hem fet una simplificació a l'hora de mostrar els resultats. Com que les nostres queris eren molt semblants entre elles i els resultats que donaven eren molt semblants, hem decidit mostrar només la query que donava els hits més òptims en cada genoma, sempre comprovant que per a la resta de queries els resultats fossin molt similars o amb puntuacions mínimament inferiors.
Per a comprovar que les nostres queries eren realment molt semblants i podíem fer aquesta simplificació hem realitzat un TCoffee entre totes les nostres queries. Per veure'l, clica aquí
. Tornar a dalt »
| A.laibachi | Human |  |
|
|
|
|
|
|
 |
 |
|
| C.fasciculata | S. cerevisiae | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| A.rara | Totes | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| D.discoideum | Human | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| D.fasciculatum | S. cerevisiae | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| G.niphandrodes | Human | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| |||||||||
| I.multifiliis | Mouse | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| L.donovani | Human | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| L.tarentolae | Human | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| P.capsici | Human | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| | | | | |
|
||||
| P.polycephalum | Human | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||||
| S.arctica | Mouse | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| T.congolense | Human | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| F.cylindrus | C. reinhardtii | |
|||||||||
Per buscar proteïnes de la família de SelW hem utilitzat 8 queries diferents de varis organismes. En l'anàlisi hem comparat totes les queries contra cada un dels genomes. En les taules, però, per a cada genoma només es mostra el resultat fruit de comparar una sola query.
Això es deu a què hem fet una simplificació a l'hora de mostrar els resultats. Com que les nostres queris eren molt semblants entre elles i els resultats que donaven eren molt semblants, hem decidit mostrar només la query que donava els hits més òptims en cada genoma, sempre comprovant que per a la resta de queries els resultats fossin molt similars o amb puntuacions mínimament inferiors.
Per a comprovar que les nostres queries eren realment molt semblants i podíem fer aquesta simplificació hem realitzat un TCoffee entre totes les nostres queries. Per veure'l, clica aquí
. Tornar a dalt »