T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=96
*
 BAD AVG GOOD
*
SPP00000012_1.0   :  96
PHYCAscaffold_1   :  96
cons              :  96

SPP00000012_1.0   MLSATRRACQLLLLHSLFPVPRMGNSASNIVSPQEALPGRKEQTP
PHYCAscaffold_1   ---------------------------------------------

cons                                                           


SPP00000012_1.0   VAAKHHVNGNRTVEPFPEGTQMAVFGMGXFWGAERKFWVLKGVYS
PHYCAscaffold_1   ---------------------IATFAAGCFWAVQRSFDNVPGVIA

cons                                   :*.*. * **..:*.*  : ** :


SPP00000012_1.0   TQVGFAGGYTSNPTYKEVCSEKTGHAEVVRVVYQPEHMSFEELLK
PHYCAscaffold_1   TSVGYAQGKTENPTYRTVVTGRTNHAESIKITFDESQVTYEELLK

cons              *.**:* * *.****: * : :*.*** :::.:: .::::*****


SPP00000012_1.0   VFWENHDPTQGMRQGNDHGTQYRSAIYPTSAKQMEAALSSKENYQ
PHYCAscaffold_1   VFWSIHDPTSLNRQEGDVGTQYRSGIYYQDEEQHKIALKSKDEHQ

cons              ***. ****.  ** .* ******.**  . :* : **.**:::*


SPP00000012_1.0   KVLSEHGFGPITTDIREGQTFYYAEDYHQQYLSKNPNGYCGLGGT
PHYCAscaffold_1   KTLDK----PIVTEIEAAKTFWDAEEAHQKYLEKG--GNCSDKGS

cons              *.*.:    **.*:*. .:**: **: **:**.*.  * *.  *:


SPP00000012_1.0   GVSCPVGIKK
PHYCAscaffold_1   DVQ------C

cons              .*.