Recerca de selenoproteïnes en protistes:
SelW,MsrA
Carlevaro J.; Casas A.; Eraso A.; Farrés A.; Gamallo B.
Taula SelW
Per veure la discussió de cada organisme, cliqueu sobre la casella de la taula corresponent.
Per buscar proteïnes de la família de SelW hem utilitzat 8 queries diferents de varis organismes. En l'anàlisi hem comparat totes les queries contra cada un dels genomes. En les taules, però, per a cada genoma només es mostra el resultat fruit de comparar una sola query.
Això es deu a què hem fet una simplificació a l'hora de mostrar els resultats. Com que les nostres queris eren molt semblants entre elles i els resultats que donaven eren molt semblants, hem decidit mostrar només la query que donava els hits més òptims en cada genoma, sempre comprovant que per a la resta de queries els resultats fossin molt similars o amb puntuacions mínimament inferiors.
Per a comprovar que les nostres queries eren realment molt semblants i podíem fer aquesta simplificació hem realitzat un TCoffee entre totes les nostres queries. Per veure'l, clica aquí
.
| A.laibachi | Totes |  |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| C.fasciculata | Totes | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| A.rara | Totes | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| D.discoideum | Totes | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| D.fasciculatum | Totes | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| F.cylindrus | Totes | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| G.niphandrodes | Totes | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| I.multifilis | T.thermophila |  |
| | | | | | |
 |
|
| | | | | | |
|
||||
| | | |
| |
|
|
||||
| L.donovani | Totes | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| L.tarentolae | Totes | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| P.capsici | Bos taurus | |
|
|
|
|
|
|
|
 |
|
| P.polycephalum | Totes | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| S.arctica | Totes | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| T.congolense | Totes | |
|
|
|
|
|
|
|
|
Per buscar proteïnes de la família de SelW hem utilitzat 8 queries diferents de varis organismes. En l'anàlisi hem comparat totes les queries contra cada un dels genomes. En les taules, però, per a cada genoma només es mostra el resultat fruit de comparar una sola query.
Això es deu a què hem fet una simplificació a l'hora de mostrar els resultats. Com que les nostres queris eren molt semblants entre elles i els resultats que donaven eren molt semblants, hem decidit mostrar només la query que donava els hits més òptims en cada genoma, sempre comprovant que per a la resta de queries els resultats fossin molt similars o amb puntuacions mínimament inferiors.
Per a comprovar que les nostres queries eren realment molt semblants i podíem fer aquesta simplificació hem realitzat un TCoffee entre totes les nostres queries. Per veure'l, clica aquí
.
Tornar a dalt »