En el genoma de
C. fasciculata, hem obtingut mitjançant tBLASTn
(veure tblastn) amb la query de
Saccharomyces cerevisiae un total de 3 hits, dels quals només un és estadísticament significatiu (e-value 1e-23). La query de
S. cerevisiae correspon a un homòleg amb cisteïna de MsrA. Aquesta cisteïna (X) de la query veiem que alinea perfectament amb la cisteïna (C) del hit, que correspon a un codó TGC.
La predicció amb l'Exonerate i el GeneWise ens resulta en dues proteïnes diferents. L'Exonerate
(veure) ens prediu un intró de 36 pb enmig de la seqüència, mentre que el GeneWise
(veure) accepta com a codificant aquesta regió de la seqüència. Al fer un T-COFFEE
(veure) entre les dues proteïnes predites veiem que són idèntiques, tot i que la proteïna predita pel GeneWise és més llarga degut a aquesta regió esmentada. És a dir, veiem que la única diferència es troba a la regió del possible intró. A més, alineem cadascuna de les proteïnes predites amb la query mitjançant un T-COFFEE i observem que es produeix un millor alineament i amb un millor score en el cas de la proteïna predita amb l'Exonerate
(T-COFFE resultat Exonerate)(veure T-COFFEE resultat GeneWise).
Tot i així, hem decidit realitzat un BLASTp amb les dues proteïnes predites per acabar de sortir de dubtes i saber quina de les dues proteïnes és més probable. En ambdós casos obtenim els mateixos hits, que coincideixen també amb els trobats en el cas de l'organisme
Leishmania tarentolae (veure discussio). Observem que l'alineament realitzat amb la proteïna predita pel GeneWise
(veure BLASTp) és millor (score 266 i Max iden 74%) que en el cas de l'Exonerate (score 250 i Max iden 68%)
(veure BLASTp). El fet que l'Exonerate interpreti la regió esmentada com a intró pensem que fa que obtingui aquesta puntuació inferior amb el BLASTp ja que hem vist que en el cas dels organismes de la família
Leishmania aquesta regió és codificant. És per això que ens decantem per la proteïna predita pel GeneWise com a proteïna que s'acostarà més a la proteïna homòloga amb cisteïna de MsrA present en
C. fasciculata.