Resultats per a la família GPx
Tal i com hem comentat anteriorment, la família de proteïnes Glutatió Peroxidasa X (GPx) està formada per 8 tipus de proteïnes diferents, 6 dels quals són selenoproteïnes (GPx1, GPx2, GPx3, GPx4 i GPx6).
Abans de començar la cerca de GPx en el genoma dels protistes a analitzar, hem realitzat un alineament múlitple amb T-Coffee per tal de comprovar la similitud entre les diferents GPx humanes.
Els resultats mostren l'elevat grau de similitud entre les diferents queries i compleix els requeriments d'un bon alineament al T-Coffee, és a dir, una elevada cobertura i un score elevat. És per aquest motiu que hem decidit unificar l'anàlisi de tots els genomes amb una única query, corresponent a la GPx1.
A continuació es mostra una taula amb els resultats obtinguts per aquesta selenoproteïna. Podeu observar la discussó dels resultats obtinguts per a cada organisme clicant a sobre del nom del protista que us interessi.
| tBlasTn | Exonerate | cDNA | Proteïna | GeneWise | T_coffee | SECIS | |
| A.Laibachii |  |
|
|
|
|
|
 |
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
||
| A.Rara | |
|
|
|
|
|
|
| C.Fasciculata | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
||
| D.Discoideum | |
|
|
|
|
|
|
| D.Fasciculatum | |
|
|
|
|
|
|
| F.Cylindrus | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
||
| G.Niphandrodres | |
|
|
|
|
|
|
| I.Multifiliis | |
|
|
|
|
|
|
| L.Donovani | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
| L.Tarentolae | |
|
|
|
|
|
|
| P.Capsici | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
||
|
|
|
|
|
|
||
| P.Polycephalum | |
|
|
|
|
|
|
| S.Arctica | |
|
|
|
|
|
|
| T.Congolense | |
|
|
|
|
|
|