Selenoproteïnes en Protistes

	Query	Hits significatius	E-Value	tBLASTn	Exonerate GeneWise	T-Coffee	Predicció	SECIS
P. tricornutum	S. cerevisiae	3	5·10-19 6·10-14 9·10-13				HCys	-
H. arabidopsidis	P. infestans	2	4·10-39 8·10-19				HCys	-
P. ultimum	P. infestans	2	1·10-55 1·10-34				HCys HCys	-
S. parasitica	C. elegans	4	7·10-24 2·10-23 6·10-22 1·10-21				HCys HCys HCys	-
E. siliculosus	C. elegans	2	3·10-8 3·10-5				HCys	-
C. muris	S. cerevisiaeC.elegans	0	- -		-	-	-	-
C. parvum	S. cerevisiaeC.elegans	0	- -		-	-	-	-
A. taiwanensis	S. cerevisiaeC. elegansO. lucimarinus	3	2·10-6 6·10-7 1·10-22		-	-	-	-
C.owczarzaki	C. elegans	2	1·10-18 5·10-13				HCys HCys	-
P. pallidum	S. cerevisiae	1	9·10-29				HCys	-
C. merolae	C. elegans	1	3·10-31				HCys	-
T. trahens	C. elegans	1	3·10-15				HCys	-
N. gruberi	C. elegans	1	1·10-16				HCys	-

S'ha realitzat un blastp amb les seqüències predites per buscar la funció d'altres proteïnes semblants a la base de dades de NCBI. Les coincidències obtingudes ratifiquen els resultats de la taula. Prémer aquí per descarregar els resultats.

Per últim, s'ha alineat mitjançant T-Coffee totes les proteïnes obtingudes i les querys utilitzades. El resultat pot veure's en format .txt o en format .html.

Torna