Família TR



A.anophagefferens
C.elegans.TR1
H.sapiens.TR1
H.sapiens.TR3
M.musculus.TR2
M.musculus.TR3
S.parasitica

*Nota: Proteïna fa referència al resultat del fastatranslate querys
**Nota: Clica als diferents protists per veure informació més detallada sobre les querys

Resultats positus
Resultats negatius

I.multifiliis strain G5

Al fer el tBLASTn amb aquest genoma hem obtingut tres regions del genoma amb hits significatius: gi|340500124|gb|GL984390.1|, gi|340500396|gb|GL984375.1| i gi|340503816|gb|GL984010.1|. Per tant fem l'exonerate amb aquestes tres regions. En cap de les tres regions obtenim proteïnes funcionals ja que presenten codons stop al llarg de tota la seqüència.

El Genewise tampoc ens ha donat resultats en la regió gi|340500124|gb|GL984390.1| ni en la gi|340500396|gb|GL984375.1|, ha generat proteïnes amb codons stop pel mig, en canvi, per la regió gi|340503816|gb|GL984010.1| (resultats mostrats a la taula) hem obtingut una seqüència de 36 aminoàcids. Hem fet un BLASTp d'aquesta seqüència on surt homologia amb diferents proteïnes de la família TR, incloses TR putatives de I.multifiliis però es troben en contigs diferents als que nosaltres hem analitzat. Hem mirat el tBLASTn sense la opció -e (per obtenir tots els resultats sense límit d'E-value) i aquests contigs no apareixen com a hits.

Tampoc hem trobat elements SECIS en cap d'aquestes regions del genoma.