RESULTADOS
En la tabla siguiente, mostramos para cada query: la predicción de la proteína realizada mediante exonerate y genewise, la predicción del mejor alineamiento con el programa tcoffee, la predicción, si existen, de elementos SECIS mediante el programa SESISearch3 y la predicción de selenoproteínas homólogas en otras especies, si existen, mediante el programa Seblastian.
| S E L E N O P R O T E Í N A S |
SELENOPROTEÍNA | ESPECIE | SCAFFOLD | Archivos | GENEWISE | PROTEÍNA CONSERVADA | SECIS | SEBLASTIAN | |
| EXONERATE | T-Coffee | Archivos | |||||||
| GPX1 | H | KE751547.1 |  |
|
|
 |
 |
|
|
| GPX2 | P | KE814389.1 | |
|
|
|
 |
|
|
| GPX3 | H | KE810295.1 | |
|
|
|
 |
|
|
| GPX4 | H | AWHC01282061.1 | |
|
|
|
 |
|
|
| GPX5 | H | KE755429.1 | |
|
|
|
|
|
|
| GPX6 | H | |
|
|
|
 |
|
|
|
| GPX7 | H | KE813456.1 | |
|
|
|
|
|
|
| GPX8 | H | KE808138.1 | |
|
|
|
|
|
|
| DI1 | P | KE815153.1 | |
|
|
|
 |
|
|
| DI2 | P | KE817286.1 | |
|
|
|
|
|
|
| DI3 | H | AWHC01168030.1 | |
|
|
|
 |
|
|
| MsrA | P | KE749494.1* | |
|
|
|
|
|
|
| Sel15 | P | KE778117.1 | |
|
|
|
 |
|
|
| SelH | P | KE809834.1 | |
|
|
|
|
|
|
| SelI | H | AWHC01202482.1 | |
|
|
|
|
|
|
| SelK | H | KE785780.1 |
|
|
|
|
 |
|
|
| SelM | P | KE819481.1 | |
|
|
|
 |
|
|
| SelN | H | KE799186.1 | |
|
|
|
 |
|
|
| SelO | H | KE752061.1 | |
|
|
|
 |
|
|
| SelP | P | KE762614.1 | |
|
|
|
  |
|
|
| SelR1 | P | KE760349.1 | |
|
|
|
 |
|
|
| SelR2 | H | KE755266.1 | |
|
|
|
|
|
|
| SelR3 | H | KE754241.1 | |
|
|
|
|
|
|
| SelS | H | KE756635.1 | |
|
|
|
 |
|
|
| SelT | H | AWHC01261594.1 | |
|
|
|
|
|
|
| SelU1 | H | KE816858.1 | |
|
|
|
|
|
|
| SelU2 | H | KE819056.1 | |
|
|
|
|
|
|
| SelU3 | P | KE769133.1 | |
|
|
|
|
|
|
| SelV | H | KE799521.1 | |
|
|
|
 |
|
|
| SelW1 | P | KE761826.1 | |
|
|
|
 |
|
|
| SelW2 | H | |
|
|
|
|
|
|
|
| TR1 | H | KE766852.1 | |
|
|
|
|
|
|
| TR2 | H | KE791502.1 | |
|
|
|
 |
|
|
| TR3 | H | KE790577.1 | |
|
|
|
|
|
|
| M A Q U I N A R I A |
eEFSec | P | KE790409.1 | |
|
|
|
|
|
| pstk | H | KE759553.1 | |
|
|
|
|
|
|
| SBP2 | H | KE806098.1 | |
|
|
|
|
|
|
| SECp43 | H | KE815164.1 | |
|
|
|
|
|
|
| SecS | H | KE796598.1 | |
|
|
|
|
|
|
| SPS1 | P | AWHC01215926.1 | |
|
|
|
|
|
|
| SPS2 | P | KE805803.1 | |
|
|
|
 |
|
|
Clicar aquí para ver la lista con las secuencias de las selenoproteínas predichas en Eidolon helvum.
Clicar aquí para ver la lista con los elementos SECIS predichos en Eidolon helvum.
| SÍMBOLO o COLOR | SIGNIFICADO |
* |
La proteína MSRA está dividida en 4 scaffolds diferentes, en esta tabla sólo nombramos uno de estos. Está explicado en la discusión |
|
En color azul se han marcado las proteínas homólogas de cisteína |
| | Existe el archivo |
| No existe el archivo |
| La proteína se encuentra conservada |
| La proteína no se encuentra conservada |