Selenoproteïnes En Genomes de Protistes

A continuació es mostra la taula amb els resultats dels diferents programes descrits a materials i mètodes per a la proteïna GPx1 humana. Podeu accedir al resultat original en cada cas clicant a la icona corresponent.

Protista	Tblastn	Alineament	E-value	Exonerate	Genewise	Proteïna	Comparació	SECIS
A.taiwanensis
C.merolae
C.muris		CIS	1e-11
C.owczarzaki
C.parvum		CIS	5e-13
E.siliculosus
H.arabidopsidis		CIS NULL CIS CIS GAP CIS	6e-38 6e-38 3e-23 3e-22 8e-12 8e-11
N.gruberi		CIS CIS CIS NULL CIS CIS NULL NULL	1e-24 2e-18 4e-15 5e-14 5e-14 7e-14 2e-10 2e-10
P.pallidum		NULL LIS NULL	7e-19 4e-21 4e-21
P.tricornutum			1e-17 5e-14 2e-07
P.ultimum		CIS NULL CIS CIS CIS CIS CIS CIS CIS SER CIS ASP	1e-43 9e-12 2e-07 2e-26 2e-26 2e-26 4e-25 5e-25 7e-25 8e-24 4e-22 6e-11
S.parasitica		STOP STOP SER STOP NULL	2e-25 6e-25 2e-16 3e-19 8e-09
T.trahens		STOP STOP SER NULL CIS NULL STOP	4e-33 3e-21 4e-07 8e-15 8e-12 1e-08 4e-07

*La icona indica que aquell programa ha produït un resultat però no comporta que aquests siguin signficatius.
(ex1: Un en l'apartat BLAST indica que s'han trobat hits)
(ex2: Un en l'apartat proteïna NO indica que s'hagi predit correctament una proteïna, simplement que s'ha predit una seqüència aminoacidica amb sentit).

Tornar a GPx