Com ja hem comentat abans la família Glutatione Peroxidsae X (GPx) en humans està constituïda per 8 proteïnes, 6 de les quals són selenoproteïnes (GPx1, GPx2, GPx3, GPx4 i GPx6). En aquest apartat hem inclòs els resultats detallats per cadascuna en forma de taula, podeu accedir-hi des de l'apartat Contiguts del marge esquerre.
No obstant, no hem realitzat una discussió independent per a cada selenoproteïna de la família perquè en observar els resultats del tBLASTn vam concloure que totes les queries produien els mateixos hits ja que, tot i que els E-values eren lleugerament diferents, tots se situaven a les mateixes regions genòmiques i acabàvem predint les mateixes proteïnes.
Vam decidir alinear les 5 querys per comprovar la seva similitud i tal com es pot observar al T-coffee que apareix més abaix l'score obtingut és molt alt.
Per aquest motiu vam decidir unificar la discussió de totes les proteïnes de la família per a cada un dels organismes analitzats, de manera que ens referirem de manera genèrica a la família GPx quan comentem els resultats predits.
T-COFFEE, Version_8.93(Thu Aug 5 18:09:23 CEST 2010)
Cedric Notredame
CPU TIME:0 sec.
SCORE=94
*
BAD AVG GOOD
*
SPP00000004_1.0 : 95
SPP00000005_1.0 : 94
SPP00000006_1.0 : 95
SPP00000007_1.0 : 91
SPP00000009_1.0 : 95
cons : 94
SPP00000004_1.0 ------------------------ELQRRLGPR
SPP00000005_1.0 ---------------------------------
SPP00000006_1.0 GKYVLFVNVAS-YXGLTGQYIELNALQEELAPF
SPP00000007_1.0 GFVCIVTNVASQXGKTEVNYTQLVDLHARYAEC
SPP00000009_1.0 GKHVLFVNVAA-YXGLAAQYPELNALQEELKNF
cons
SPP00000004_1.0 GLVVLGFPCNQFGHQENAKNEEILNSLKYVRPG
SPP00000005_1.0 -LVVLGFPCNQFGHQENCQNEEILNSLKYVRPG
SPP00000006_1.0 GLVILGFPCNQFGKQEPGENSEILPTLKYVRPG
SPP00000007_1.0 GLRILAFPCNQFGKQEPGSNEEIKE------FA
SPP00000009_1.0 GVIVLAFPCNQFGKQEPGTNSEILLGLKYVCPG
cons : :*.*******:** *.** .
SPP00000004_1.0 GGFEPNFMLFEKCEVNGAGAHPLFAFLREALPA
SPP00000005_1.0 GGYQPTFTLVQKCEVNGQNEHPVFAYLKDKLPY
SPP00000006_1.0 GGFVPNFQLFEKGDVNGEKEQKFYTFLKNSCPP
SPP00000007_1.0 AGYNVKFDMFSKICVNGDDAHPLWKWMKIQ-PK
SPP00000009_1.0 SGFVPSFQLFEKGDVNGEKEQKVFTFLKNSCPP
cons .*: .* :..* *** : .: ::: *
SPP00000004_1.0 PSDDATALMTDPKLITWSPVCRNDVAWNFEKFL
SPP00000005_1.0 PYDDPFSLMTDPKLIIWSPVRRSDVAWNFEKFL
SPP00000006_1.0 TSE----LLGTSDRLFWEPMKVHDIRWNFEKFL
SPP00000007_1.0 GKG----IL------------GNAIKWNFTKFL
SPP00000009_1.0 TSD----LLGSSSQLFWEPMKVHDIRWNFEKFL
cons :: : *** ***
SPP00000004_1.0 VGPDGVPLRRYSRRFQTIDIEPDIEALLSQG--
SPP00000005_1.0 IGPEGEPFRRYSRTFPTINIEPDIKRLLKV---
SPP00000006_1.0 VGPDGIPIMRWHHRTTVSNVKMDILSYMRRQAA
SPP00000007_1.0 IDKNGCVVKRYGPMEEPLVIEKDLPHY------
SPP00000009_1.0 VGPDGVPVMHWFHQAPVSTVKSDILEYLKQF--
cons :. :* . :: :: *:
SPP00000004_1.0 --PSCA
SPP00000005_1.0 ----AI
SPP00000006_1.0 LGVKRK
SPP00000007_1.0 -----F
SPP00000009_1.0 ---NTH
cons
