En l'anàlisi del tBLASTn de la query contra el genoma d'aquest organisme obtenim 3 hits. Només un d'ells és estadísticament significatiu (E-value 5e-13). En aquest hit, la Sec alinea amb Cis.
Seguim l'anàlisi amb Exonerate i el resultat concorda amb el del tBLASTn, ja que la Sec de la query alinea amb la mateixa Cis del subject i aquesta correspon a un codó TGT.
La predicció del Genewise dóna una proteïna gairebé idèntica a la d'Exonerate (la predita pel Genewise és leugerament més llarga, com passa també en molts altres casos).
Realitzem l'alineament de la proteïna predita pel Genewise amb la query original i observem una similaritat altíssima, de fet, trobem que les seqüencies són gairebé idèntiques a excepció que la proteïna que hem predit és molt més curta.
Podem hipotetitzar que o bé la nostra proteïna, al tractar-se d'un homòleg amb cisteina, no ha conservat aquesta part de la seqüència, o simplement, els nostres programes no han predit aquesta regió tot i que sí que es troba en el genoma.
No s'han predit elements SECIS en aquesta regió, el que concordaria amb el fet que aquesta proteïna no és una selenoproteïna i per tant els elements SECIS poden haver-se perdut.
Per últim, vam realitzar un BLASTp amb la proteïna predita i vàrem veure que la proteïna en qüestió ja havia estat descrita en un article publicat a Science l'any 2004.
