Resultats

Selenoproteïnes

	Danio rerio
	Homo sapiens
	No es troba a Astyanax mexicanus
	Sí que es troba a Astyanax mexicanus

Maquinària proteica

	Danio rerio
	Homo sapiens
	No es troba a Astyanax mexicanus
	Sí que es troba a Astyanax mexicanus

Anàlisi de selenoproteïnes

Un cop localitzades totes les proteïnes d’interès en el genoma de la nostra espècie es va procedir a l’anàlisi individual de cada proteïna per tal d’obtenir la informació més rellevant. Per tal de fer això, es van tenir en compte les següents característiques de cadascuna, les quals extraiem dels resultats de l’exonerate:

-Localització del gen i sentit de la cadena en l’scaffold estudiat.

-Nombre d’exons.

-Localització de la selenocisteïna.

-Elements SECIS (obtinguts a partir del Seblastian).

Cal comentar que en els casos en els quals es va obtenir més d’un element SECIS es va donar per bo aquell amb un grau més elevat, tenint en compte que el màxim grau és A.

Per altra part, a l’hora de fer les figures de cada proteïna, hem considerat les posicions dels exons respecte la posició dintre de l’scaffold i no dintre del genoma sencer.

	13 selenocisteïnes
	1 selenocisteïna
	Element SECIS
	Exó

Família Sel15

Sel15:La proteïna Sel15 es localitza en l’scaffold APWO02000136.1 entre les posicions 25583 i 28620, a la cadena positiva (forward). El gen que codifica per la proteïna conté 5 exons i presenta una selenocisteïna a l’exó 3. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

Es va trobar un element SECIS de grau B en l’extrem 3’ UTR.

Família SelenoE

SelenoE:La proteïna SelenoE es localitza en l’scaffold APWO02000144.1 entre les posicions 1887301 i 1894536, a la cadena positiva (forward). El gen que codifica per la proteïna conté 4 exons i presenta una selenocisteïna a l’exó 2. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

Es va trobar un element SECIS de grau A en l’extrem 3’ UTR.

Família GPx

GPx1a:La proteïna GPx1a es localitza en l’scaffold CM008312.1 entre les posicions 34539591 i 34541791, a la cadena negativa (reverse). El gen que codifica per la proteïna conté 2 exons i presenta una selenocisteïna a l’exó 1. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

Es va trobar un element SECIS de grau A en l’extrem 3’ UTR.

GPx1b:La proteïna GPx1b es localitza en l’scaffold CM008321.1 entre les posicions 21112814 i 21114803, a la cadena negativa (reverse). El gen que codifica per la proteïna conté 2 exons i presenta una selenocisteïna a l’exó 1. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

Es va trobar un element SECIS de grau A en l’extrem 3’ UTR.

GPx2:La proteïna GPx2 es localitza en l’scaffold CM008308.1 entre les posicions 1439295 i 1440959, a la cadena negativa (reverse). El gen que codifica per la proteïna conté 2 exons i presenta una selenocisteïna a l’exó 1. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

Es va trobar un element SECIS de grau A en l’extrem 3’ UTR.

GPx3a:La proteïna GPx3a es localitza en l’scaffold CM008307.1 entre les posicions 2690681 i 2699497, a la cadena positiva (forward). El gen que codifica per la proteïna conté 6 exons i presenta una selenocisteïna a l’exó 3. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

Es va trobar un element SECIS de grau A en l’extrem 3’ UTR.

GPx3b:La proteïna GPx3b es localitza en l’scaffold APWO02000079.1 entre les posicions 654940 i 663619, a la cadena negativa (reverse). El gen que codifica per la proteïna conté 5 exons i presenta una selenocisteïna a l’exó 1. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

Es va trobar un element SECIS de grau B en l’extrem 3’ UTR.

GPx4a:La proteïna GPx4a es localitza en l’scaffold CM008304.1 entre les posicions 12337764 i 12338566, a la cadena positiva (forward). El gen que codifica per la proteïna conté 3 exons i presenta una selenocisteïna a l’exó 1. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

Es va trobar un element SECIS de grau A en l’extrem 3’ UTR.

GPx4b:La proteïna GPx4b es localitza en l’scaffold CM008316.1 entre les posicions 8766454 i 8769523, a la cadena negativa (reverse). El gen que codifica per la proteïna conté 5 exons i presenta una selenocisteïna a l’exó 2. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

Es va trobar un element SECIS de grau A en l’extrem 3’ UTR.

GPx7:La proteïna GPx7 es localitza en l’scaffold APWO02002209.1 entre les posicions 341499 i 345945, a la cadena negativa (reverse). El gen que codifica per la proteïna conté 3 exons i no presenta cap selenocisteïna. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

No es va trobar cap element SECIS en l’extrem 3’ UTR.

GPx8:La proteïna GPx8 es localitza en l’scaffold CM008305.1 entre les posicions 28503530 i 28505749, a la cadena positiva (forward). El gen que codifica per la proteïna conté 3 exons i no presenta cap selenocisteïna. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

No es va trobar cap element SECIS en l’extrem 3’ UTR.

Família DIO

DIO1:La proteïna DIO1 es localitza en l’scaffold CM008305.1 entre les posicions 13595986 i 13597693, a la cadena negativa (reverse). El gen que codifica per la proteïna conté 4 exons i presenta una selenocisteïna a l’exó 2. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

Es va trobar un element SECIS de grau A en l’extrem 3’ UTR.

DIO3a:La proteïna DIO3a es localitza en l’scaffold CM008302.1 entre les posicions 43260598 i 43261374, a la cadena positiva (forward). El gen que codifica per la proteïna conté 1 exó en el qual presenta una selenocisteïna. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

Es va trobar un element SECIS de grau A en l’extrem 3’ UTR.

Família MsrA

MsrA1:La proteïna MsrA es localitza en l’scaffold CM008308.1 entre les posicions 10135012 i 10155387, a la cadena negativa (reverse). El gen que codifica per la proteïna conté 7 exons i no presenta cap selenocisteïna. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

No es va trobar cap element SECIS en l’extrem 3’ UTR.

Família SelenoR (MsrB)

MsrB1A:La proteïna MsrB 1A es localitza en l’scaffold APWO02000083.1 entre les posicions 436685 i 437244, a la cadena positiva (forward). El gen que codifica per la proteïna conté 4 exons i presenta una selenocisteïna a l’exó 3. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

Es va trobar un element SECIS de grau A en l’extrem 3’ UTR.

MsrB2:La proteïna MsrB 2 es localitza en l’scaffold CM008302.1 entre les posicions 27435644 i 27438523, a la cadena positiva (forward). El gen que codifica per la proteïna conté 5 exons i no presenta cap selenocisteïna. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

No es va trobar cap element SECIS en l’extrem 3’ UTR.

MsrB3:La proteïna MsrB3 es localitza en l’scaffold CM008306.1 entre les posicions 2575696 i 2592481, a la cadena negativa (reverse). El gen que codifica per la proteïna conté 6 exons i no presenta cap selenocisteïna. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

No es va trobar cap element SECIS en l’extrem 3’ UTR.

Família SEPHS

SEPHS1:La proteïna SEPHS2 es localitza en l’scaffold CM008317.1 entre les posicions 104225 i 8484947, a la cadena negativa (reverse). El gen que codifica per la proteïna conté 8 exons i no presenta cap selenocisteïna. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

Es va trobar un element SECIS de grau B en l’extrem 3’ UTR.

SEPHS2:La proteïna SEPHS2 es localitza en l’scaffold CM008314.1 entre les posicions 24320017 i 24327867, a la cadena negativa (reverse). El gen que codifica per la proteïna conté 8 exons i presenta una selenocisteïna a l’exó 1. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

Es va trobar un element SECIS de grau B en l’extrem 3’ UTR.

Família SelenoH

SelH:La proteïna SelH es localitza en l’scaffold CM008323.1 entre les posicions 6402819 i 6403551, a la cadena negativa (reverse). El gen que codifica per la proteïna conté 3 exons i presenta una selenocisteïna a l’exó 2. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

Es va trobar un element SECIS de grau A en l’extrem 3’ UTR.

Família SelenoI

SelI:La proteïna SelI es localitza en l’scaffold CM008314.1 entre les posicions 8700905 i 8706171, a la cadena positiva (forward). El gen que codifica per la proteïna conté 10 exons i presenta una selenocisteïna a l’exó 10. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

Es va trobar un element SECIS de grau A en l’extrem 3’ UTR.

Família SelenoJ

SelJ:La proteïna SelJ es localitza en l’scaffold APWO02000036.1 entre les posicions 1679079 i 1684598, a la cadena negativa (reverse). El gen que codifica per la proteïna conté 6 exons i presenta dues selenocisteïnes a l’exó 3 i una l’exó 6. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

Es va trobar un element SECIS de grau A en l’extrem 3’ UTR.

Família SelenoK

SelK:La proteïna SelK es localitza en l’scaffold CM008305.1 entre les posicions 47916651 i 47917305, a la cadena negativa (reverse). El gen que codifica per la proteïna conté 5 exons i presenta una selenocisteïna a l’exó 4. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

Es va trobar un element SECIS de grau A a l’extrem 3’ UTR.

Família SelenoL

SelL:La proteïna SelL es localitza en l’scaffold CM008302.1 entre les posicions 25764952 i 25769797, a la cadena positiva (forward). El gen que codifica per la proteïna conté 9 exons i presenta dues selenocisteïnes a l’exó 6 i una al l’exó 9. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

Es va trobar un element SECIS de grau A en l’extrem 3’ UTR.

Família SelenoM

La proteïna SelM es localitza en l’scaffold APWO02000095.1 entre les posicions 290874 i 298120. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

Família SelenoO

SelO1:La proteïna SelO1 es localitza en l’scaffold CM008317.1 entre les posicions 13807946 i 13815460, a la cadena negativa (reverse). El gen que codifica per la proteïna conté 9 exons i presenta una selenocisteïna a l’exó 9. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

Es va trobar un element SECIS de grau A en l’extrem 3’ UTR.

Família SelenoP

SelP1:La proteïna SelP1 es localitza en l’scaffold CM008316.1 entre les posicions 19660568 i 19662612, a la cadena negativa (reverse). El gen que codifica per la proteïna conté 5 exons i presenta una selenocisteïna a l’exó 1, a l’exó 4 i a l’exó 5. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

Es va trobar un element SECIS de grau A en l’extrem 3’ UTR.

SelP2:La proteïna SelP2 es localitza en l’scaffold CM008305.1 entre les posicions 28260221 i 28261992, a la cadena negativa (reverse). El gen que codifica per la proteïna conté 6 exons i presenta 13 selenocisteïnes a l’exó 6. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

Es van trobar dos elements SECIS de grau A en l’extrem 3’ UTR.

Família SelenoT

SelT1:La proteïna SelT1 es localitza en l’scaffold CM008315.1 entre les posicions 3115483 i 3117903, a la cadena positiva (forward). El gen que codifica per la proteïna conté 5 exons i presenta una selenocisteïna a l’exó 2. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

Es va trobar un element SECIS de grau A en l’extrem 3’ UTR.

SelT1b:La proteïna SelT1b es localitza en l’scaffold CM008317.1 entre les posicions 22895807 i 22899305, a la cadena negativa (reverse). El gen que codifica per la proteïna conté 5 exons i presenta una selenocisteïna a l’exó 2. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

Es va trobar un element SECIS de grau A en l’extrem 3’ UTR.

Família SelenoU

SelU2:La proteïna SelU2 es localitza en l’scaffold CM008305.1 entre les posicions 26530669 i 26533395, a la cadena positiva (forward). El gen que codifica per la proteïna conté 6 exons i no presenta cap selenocisteïna. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

No es va trobar cap element SECIS en l’extrem 3’ UTR.

SelU3:La proteïna SelU3 es localitza en l’scaffold CM008321.1 entre les posicions 4561972 i 4565811, a la cadena positiva (forward). El gen que codifica per la proteïna conté 6 exons i no presenta cap selenocisteïna. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

No es va trobar cap element SECIS en l’extrem 3’ UTR.

Família SelenoW

SelW (I):La proteïna SelWI es localitza en l’scaffold APWO02000046.1 entre les posicions 4565811 i 831943, a la cadena positiva (forward). El gen que codifica per la proteïna conté 4 exons i presenta una selenocisteïna a l’exó 2. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

Es va trobar un element SECIS de grau A en l’extrem 3’ UTR.

SelW (II):La proteïna SelWII es localitza en l’scaffold APWO02000046.1 entre les posicions 829686 i 830950, a la cadena positiva (forward). El gen que codifica per la proteïna conté 4 exons i presenta una selenocisteïna a l’exó 2. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

Es va trobar un element SECIS de grau A en l’extrem 3’ UTR.

SelW (III):La proteïna SelW (III) es localitza en l’scaffold CM008302.1 entre les posicions 11592115 i 11592189, a la cadena negativa (reverse). El gen que codifica per la proteïna conté 5 exons i presenta una selenocisteïna a l’exó 2. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

Es va trobar un element SECIS de grau B en l’extrem 3’ UTR.

Família TXNRD

TXNRD2:La proteïna TXNRD2 es localitza en l’scaffold APWO02000039.1 entre les posicions 339246 i 376807, a la cadena positiva (forward). El gen que codifica per la proteïna conté 16 exons i presenta una selenocisteïna a l’exó 3 i una altra a l’exó 16. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

Es van trobar un element SECIS de grau A en l’extrem 3’ UTR.

TXNRD3:La proteïna TXNRD3 es localitza en l’scaffold CM008312.1 entre les posicions 32782757 i 32795253, a la cadena negativa (reverse). El gen que codifica per la proteïna conté 16 exons i presenta una selenocisteïna a l’exó 16. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

Es va trobar un element SECIS de grau A en l’extrem 3’ UTR.

Anàlisi de la maquinària

Un cop localitzades totes les proteïnes d’interès en el genoma de la nostra espècie es va procedir a l’anàlisi individual de cada proteïna per tal d’obtenir la informació més rellevant. Per tal de fer això, es van tenir en compte les següents característiques de cadascuna, les quals extraiem dels resultats de l’exonerate:

-Localització del gen i sentit de la cadena en l’scaffold estudiat.

-Nombre d’exons.

-Localització de la selenocisteïna.

-Elements SECIS (obtinguts a partir del Seblastian).

Cal comentar que en els casos en els quals es va obtenir més d’un element SECIS es va donar per bo aquell amb un grau més elevat, tenint en compte que el màxim grau és A.

Per altra part, a l’hora de fer les figures de cada proteïna, hem considerat les posicions dels exons respecte la posició dintre de l’scaffold i no dintre del genoma sencer.

	13 selenocisteïnes
	1 selenocisteïna
	Element SECIS
	Exó

Família eEFsec

eEFsec:La proteïna eEFsec es localitza en l’scaffold CM008312.1 entre les posicions 35741376 i 35746089, a la cadena positiva (forward). El gen que codifica per la proteïna conté 8 exons i no presenta cap selenocisteïna. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

Es va trobar un element SECIS de grau B en l’extrem 3’ UTR.

Família PSTK

PSTK:La proteïna PSTK es localitza en l’scaffold APWO02000119.1 entre les posicions 292693 i 294258, a la cadena negativa (reverse). El gen que codifica per la proteïna conté 4 exons i no presenta cap selenocisteïna. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

No es va trobar cap element SECIS en l’extrem 3’ UTR.

Família SBP2

SBP2:La proteïna SBP2 es localitza en l’scaffold APWO02000027.1 entre les posicions 1840639 i 7010271, a la cadena negativa (reverse). El gen que codifica per la proteïna conté 9 exons i presenta una selenocisteïna a l’exó 8. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

No es va trobar cap element SECIS en l’extrem 3’ UTR.

Família SecS

SecS:La proteïna SecS es localitza en l’scaffold APWOO2000275.1 entre les posicions 45940 i 58000, a la cadena positiva (forward). El gen que codifica per la proteïna conté 11 exons i no presenta cap selenocisteïna. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

No es va trobar cap element SECIS en l’extrem 3’ UTR.

Família SECp43

SECp43:La proteïna SECp43 es localitza en l’scaffold CM008308.1 entre les posicions 30917771 i 30919834, a la cadena negativa (reverse). El gen que codifica per la proteïna conté 6 exons i no presenta cap selenocisteïna. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

No es va trobar cap element SECIS en l’extrem 3’ UTR.

Família TTPA

TTPA:La proteïna TTPA es localitza en l’scaffold APWO0200136.1 entre les posicions 535121 i 537210, a la cadena negativa (reverse). El gen que codifica per la proteïna conté 5 exons i no presenta cap selenocisteïna. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Homo sapiens.

No es va trobar cap element SECIS en l’extrem 3’ UTR.

Família SELENBP1

SELENBP1:La proteïna SELENBP1 es localitza en l’scaffold CM008309.1 entre les posicions 28444390 i 28454837, a la cadena negativa (reverse). El gen que codifica per la proteïna conté 15 exons i presenta una selenocisteïna a l’exó 4. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Homo sapiens.

No es va trobar cap element SECIS en l’extrem 3’ UTR.

Família RPL30

RPL30:La proteïna RPL30 es localitza en l’scaffold CM008322.1 entre les posicions 22198101 i 22198846, a la cadena negativa (reverse). El gen que codifica per la proteïna conté 4 exons i no presenta cap selenocisteïna. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Homo sapiens.

No es va trobar cap element SECIS en l’extrem 3’ UTR.

Família FSEPHS

SEPHS1:La proteïna SEPHS2 es localitza en l’scaffold CM008317.1 entre les posicions 104225 i 8484947, a la cadena negativa (reverse). El gen que codifica per la proteïna conté 8 exons i no presenta cap selenocisteïna. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

Es va trobar un element SECIS de grau B en l’extrem 3’ UTR.

SEPHS2:La proteïna SEPHS2 es localitza en l’scaffold CM008314.1 entre les posicions 24320017 i 24327867, a la cadena negativa (reverse). El gen que codifica per la proteïna conté 8 exons i presenta una selenocisteïna a l’exó 1. Aquesta proteïna es va predir a partir del blast del genoma de l’Astyanax mexicanus contra la seqüència d’aquesta mateixa proteïna de Danio rerio.

Es va trobar un element SECIS de grau A en l’extrem 3’ UTR.