Recerca de Selenoproteïnes
en Nomascus leucogenys
Alemany M, Costa H, Escrig A, Gafarot I
Resultats
Per tal d'extreure unes conclusions correctes i coherents hem tingut en compte diversos paràmetres per avaluar els resultats obtinguts. Hem analitzat l'orientació del blast, que ens permetrà determinar la presència dels SECIs en funció de la seva localització; la presència de SECIs, que ens complementa la identificació de les selenoproteïnes i els homòlegs en cisteïna; l'e-value, on descartem els valors superiors a 0,001 per tal d'eliminar el factor atzar; l'homologia, que és el percentatge de la seqüència d'aminoàcids alineada respecte al nombre d'aminoàcids totals de la seqüència model; el score, el percentatge d'homologia perfecte respecte tota la alineació; els introns i exons detectats en relació als que hi consten a SelenoDB; i per últim, l'alineació de l'aminoàcid d'interès per tal de determinar si s'ha conservat o no la selenocisteïna en el cas de les selenoproteïnes, i la cisteïna en el els homòlegs en cisteïna.
Presència de la proteïna
- No ho sabem
Resultat dubtós
La seqüència dels elements SECIs trobats en les diferents selenoproteïnes estudiades es pot veure en aquest enllaç.
La seqüència de totes les selenoproteïnes trobades en Nomascus leucogenys es poden veure en aquest enllaç.