Resultats Selenoproteïna TR2

Espècie Scaffold Subseq (start-length) Orientació (blast) e-value Homologia (%) E Score E Homologia (%) G Score G Exons Introns aa d'interès Secis
Homo sapiens GL397492.1 786524-141206 Reverse 1e-027 100 100 3 100 18:17 17:16 U-->U Si
GL397326.1 9230278-124652 Forward 4e-021 38 83 13 96 18:9 17:8 U-->U No
GL397380.1 4770528-133134 Reverse 8e-020 71 60 3 95 18:9 17:8 U-->U No

Homologia (%) E i Homologia (%) G = homologia entre la query i la seqüència predita mitjançant exonerate i genewise respectivament.



Els resultats de la taula s'han obtingut mitjançant els programes explicats a l'apartat de materials i mètodes. Els podeu consultar en els següents fitxers:

GL397492.1 GL397326.1 GL397380.1
Exonerate Exonerate Exonerate
cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E)
Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E)
T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E)
Genewise Genewise Genewise
cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G)
Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G)
T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G)

També podeu trobar el blast de totes les selenoproteïnes humanes a l'enllaç tBLASTn