Resultats Glutathione peroxidase 5

Espècie Scaffold Subseq Orientació (blast) e-value Homologia (%) E Score E Homologia (%) G Score G Exons Introns aa clau Secis
Homo sapiens GL397342.1 5664884-131469 Forward 4e-035 91,4 93 100 100 5:5 4:4 C-->C No
GL397269.1 37559097-100759 Forward 3e-024 72,3 96 9,95 95 5:2 4:1 C-->G No
GL397293.1 12689009-100537 Forward 5e-024 70 73 7,5 94 5:1 4:0 C-->G No
GL397305.1 18711209-102757 Forward 2e-6 85,5 99 97,7 99 5:4 4:3 C-->- Si
GL397312.1 15866587-103202 Forward 5e-021 78,2 96 9,9 92 5:2 4:1 C-->G No
GL397296.1 751722-100278 Reverse 4e-09 24 97 9 95 5:1 4:0 C-->C No
GL397303.1 189267-100320 Forward 4e-06 20,4 95 61,3 94 5:1 4:0 C-->C No

Homologia (%) E i Homologia (%) G = homologia entre la query i la seqüència predita mitjançant exonerate i genewise respectivament

Espècie Scaffold Subseq Orientació (blast) e-value Homologia (%) E Score E Homologia (%) G Score G Exons Introns aa clau Secis
Pan Troglodytes GL397342.1 5715096-5746353 Forward 4e-35 0 0 100 100 6:5 5:4 U-->U No


Els resultats de la taula s'han obtingut mitjançant els programes explicats a l'apartat de materials i mètodes. Els podeu consultar en els següents fitxers:

GL397269.1 GL397293.1 GL397296.1 GL397303.1 GL397305.1 GL397312.1 GL397342.1
Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate
cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E)
Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E)
T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E)
Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise
cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G)
Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G)
T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G)

També podeu trobar el blast de totes les selenoproteïnes humanes a l'enllaç tBLASTn