Resultats Glutathione peroxidase 4

Espècie Scaffold Subseq Orientació (blast) e-value Homologia (%) E Score E Homologia (%) G Score G Exons Introns aa clau Secis
Homo sapiens GL397406.1 810506-101368 Forward 6e-036 100 100 100 100 7:7 6:6 U-->U Si
GL397296.1 751665-100341 Reverse 4e-015 55,3 98 6,59 90 7:2 6:1 U-->C No
GL397303.1 189261-100257 Forward 2e-6 43 96 54,2 96 7:1 6:0 U-->C No
GL397293.1 12689346-100248 Reverse 4e-08 42,5 94 7,1 95 7:1 6:0 U-->- No
GL397312.1 15869577-100218 Reverse 1e-07 37,5 95 10,5 98 7:1 6:0 U-->U Si
GL397269.1 337559713-100146 Reverse 1e-04 24,3 97 4,5 96 7:1 6:0 U-->U Si

Homologia (%) E i Homologia (%) G = homologia entre la query i la seqüència predita mitjançant exonerate i genewise respectivament

Espècie Scaffold Subseq Orientació (blast) e-value Homologia (%) E Score E Homologia (%) G Score G Exons Introns aa clau Secis
Pan Troglodytes GL397406.1 860506-861874 Forward 6e-36 100 100 100 100 7:7 6:6 U-->U Si


Els resultats de la taula s'han obtingut mitjançant els programes explicats a l'apartat de materials i mètodes. Els podeu consultar en els següents fitxers:

GL397269.1 GL397293.1 GL397296.1 GL397303.1 GL397312.1 GL397406.1
Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate
cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E)
Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E)
T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E)
Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise
cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G)
Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G)
T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G)

També podeu trobar el blast de totes les selenoproteïnes humanes a l'enllaç tBLASTn