Resultats Glutathione peroxidase 2

Espècie Scaffold Subseq (start-length) Orientació (blast) e-value Homologia (%) E Score E Homologia (%) G Score G Exons Introns aa clau Secis
Homo sapiens GL397312.1 15866578-103229 Forward 2e-064 100 100 12,63 95 2:2 1:1 U-->U No
GL397293.1 12689015-100507 Forward 8e-046 72,63,0 73 5,78 90 2:1 1:0 U-->U No
GL397269.1 37559103-100756 Forward 2e-6 84,7 99 5,78 89 2:2 1:1 U-->U No
GL397296.1 751740-100260 Reverse 1e-105 0 0 7,4 98 2:1 1:0 U-->- No
GL397342.1 5664896-131442 Forward 1e-105 96,8 74 7,4 95 2:3 1:2 U-->U No
GL397303.1 189267-100278 Forward 4e-105 0 0 81,05 90 2:1 1:0 U-->U No
GL397305.1 18713820-100128 Forward 1e-105 36,3 73 25,7 99 2:1 1:0 U-->U No

Homologia (%) E i Homologia (%) G = homologia entre la query i la seqüència predita mitjançant exonerate i genewise respectivament

Espècie Scaffold Subseq Orientació (blast) e-value Homologia (%) E Score E Homologia (%) G Score G Exons Introns aa clau Secis
Pan Troglodytes GL397312.1 15919807-15916578 Reverse 8e-64 100 100 12 95 2:2 1:1 U-->U Si


Els resultats de la taula s'han obtingut mitjançant els programes explicats a l'apartat de materials i mètodes. Els podeu consultar en els següents fitxers:

GL397269.1 GL397293.1 GL397296.1 GL397303.1 GL397305.1 GL397312.1 GL397342.1
Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate
cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E)
Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E)
T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E)
Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise
cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G)
Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G)
T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G)

També podeu trobar el blast de totes les selenoproteïnes humanes a l'enllaç tBLASTn