Recerca de Selenoproteïnes
en Nomascus leucogenys
Alemany M, Costa H, Escrig A, Gafarot I
Espècie | Scaffold | Subseq (start-length) | Orientació (blast) | e-value | Homologia (%) E | Score E | Homologia (%) G | Score G | Exons | Introns | aa clau | Secis |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Homo sapiens | GL397362.1 | 6920880-107657 | Reverse | 2e-35 | 99,7 | 99 | 6,8 | 88 | 4:4 | 4:3 | U-->U | Si |
Homologia (%) E i Homologia (%) G = homologia entre la query i la seqüència predita mitjançant exonerate
i genewise respectivament
Els resultats de la taula s'han obtingut mitjançant els programes explicats a l'apartat de materials i mètodes. Els podeu consultar en els següents fitxers:
Espècie
Scaffold
Subseq
Orientació (blast)
e-value
Homologia (%) E
Score E
Homologia (%) G
Score G
Exons
Introns
aa d'interès
Secis
Pan troglodytes
GL397362.1
6921488-106846
Reverse
7e-70
99
99
26
88
5:4
4:3
U-->U
Si
GL397362.1
Exonerate
cDNA (E)
Proteïna (E)
T-coffee (E)
Genewise
cDNA (G)
Proteïna (G)
T-coffee (G)