Resultats Selenoproteïna TR3

Espècie Scaffold Subseq (start-length) Orientació (blast) e-value Homologia (%) E Score E Homologia (%) G Score G Exons Introns aa d'interès Secis
Homo sapiens GL397380.1 4770525-137214 Reverse 4E-035 74 100 2 97 17:15 16:13 U-->U No
GL397326.1 9233823-121110 Forward 3E-031 60 99 72 99 17:12 16:11 U-->- Si
GL397492.1 788612-138039 Reverse 1e-13 46 96 6 95 17:3 16:2 U-->- Si
GL397298.1 20922652-100122 Forward 3e-10 22 99 5 99 17:1 16:0 U-->- No
GL397506.1 868979-100275 Forward 9e-5 - - - - 17:0 16:0 - No
GL397318.1 6151172-100275 Reverse 4e-4 0.13 100 6 99 17:0 16:0 U-->- No
GL397262.1 1278140-100287 Reverse 7e-4 0.13 100 3 95 17:0 16:0 U-->- No

Homologia (%) E i Homologia (%) G = homologia entre la query i la seqüència predita mitjançant exonerate i genewise respectivament.



Els resultats de la taula s'han obtingut mitjançant els programes explicats a l'apartat de materials i mètodes. Els podeu consultar en els següents fitxers:

GL397380.1 GL397326.1 GL397492.1 GL397298.1 GL397506.1 GL397318.1 GL397262.1
Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate
cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E)
Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E)
T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E)
Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise
cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G)
Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G)
T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G)

Per al GL397506.1 no ha funcionat ni l'Exonerate ni el Genewise.

També podeu trobar el blast de totes les selenoproteïnes humanes a l'enllaç tBLASTn