Recerca de Selenoproteïnes
en Nomascus leucogenys
Alemany M, Costa H, Escrig A, Gafarot I
| Espècie | Scaffold | Subseq (start-length) | Orientació (blast) | e-value | Homologia (%) E | Score E | Homologia (%) G | Score G | Exons | Introns | aa d'interès | Secis |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Homo sapiens | GL397348.1 | 3177974-100314 | Reverse | 8e-022 | 46 | 99 | 5 | 100 | 6:1 | 5:0 | C-->F | No |
| GL397279.1 | 4428805-110774 | Reverse | 3e-018 | 100 | 100 | 7 | 93 | 6:6 | 5:5 | C-->C | No |
Homologia (%) E i Homologia (%) G = homologia entre la query i la seqüència predita mitjançant exonerate i genewise respectivament.
Els resultats de la taula s'han obtingut mitjançant els programes explicats a l'apartat de materials i mètodes. Els podeu consultar en els següents fitxers:
| GL397348.1 | GL397279.1 |
|---|---|
| Exonerate | Exonerate |
| cDNA (E) | cDNA (E) |
| Proteïna (E) | Proteïna (E) |
| T-coffee (E) | T-coffee (E) |
| Genewise | Genewise |
| cDNA (G) | cDNA (G) |
| Proteïna (G) | Proteïna (G) |
| T-coffee (G) | T-coffee (G) |