Resultats SECIS binding protein 2

Espècie Scaffold Subseq (start-length) Orientació (blast) e-value Homologia (%) E Score E Homologia (%) G Score G Exons Introns aa d'interès Secis
GL397295.1 13241172-100314 Reverse 7e-9 27,6 57 1,3 95 17:1 16:0 - Si
GL397306.1 10026590-101272 Forward 1e-20 95,3 97 1,9 97 17:3 16:2 - Si
GL397332.1 9281299-101732 Forward 9e-19 68,1 49 4,3 58 17:2 16:1 - No
GL397553.1 641388-57794 Forward 5e-39 99,9 99 99,9 99 17:17 16:16 - Si

Homologia (%) E i Homologia (%) G = homologia entre la query i la seqüència predita mitjançant exonerate i genewise respectivament

Els resultats de la taula s'han obtingut mitjançant els programes explicats a l'apartat de materials i mètodes. Els podeu consultar en els següents fitxers:

GL397295.1 GL397306.1 GL397332.1 GL397553.1
Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate
cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E)
Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E)
T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E)
Genewise Genewise Genewise Genewise
cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G)
Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G)
T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G)

També podeu trobar el blast de totes les selenoproteïnes humanes a l'enllaç tBLASTn