Resultats Selenophosphate synthetase 2

Espècie Scaffold Subseq (start-length) Orientació (blast) e-value Homologia (%) E Score E Homologia (%) G Score G Exons Introns aa d'interès Secis
Homo sapiens GL397261.1 67554460-101076 Reverse 3e-138 71,7 99 2,5 90 1:1 0:0 U-->- No
GL397263.1 43683218-101136 Forward 1e-134 72,3 99 84,2 97 1:1 0:0 U-->A No
GL397271.1 12257949-121578 Forward 9e-27 44,2 60 85,9 97 1:1 0:0 U-->T Si
GL397290.1 14125921-101199 Forward 5e-57 97,3 74 93,3 97 1:1 0:0 U-->U No
GL397313.1 14976831-101156 Forward 7e-140 94,2 85 85,7 97 1:1 0:0 U-->U Si
GL397317.1 10801367-100566 Reverse 2e-39 89,3 69 6 89 1:1 0:0 U-->U No
GL397334.1 10695668-101157 Forward 2e-21 100 79 4 85 1:1 0:0 U-->U No
GL397337.1 11083845-40245 Forward 1e-20 27,7 75 29,7 95 1:1 0:0 U-->- Si
GL397338.1 - - 4e-139 - - - - - - - -
GL397375.1 578428-100599 Reverse 4e-36 54 54 3,8 94 1:1 0:0 U-->- No
GL397393.1 2815390-101010 Forward 2e-27 54,7 51 69 98 1:1 0:0 U-->- No
GL397457.1 919254-100920 Reverse 2e-68 90,8 68 5,6 95 1:1 0:0 U-->- No
GL397496.1 143758-101237 Reverse 0 60,7 51 6,3 86 1:1 0:0 U-->- Si
GL397566.1 215832-101157 Forward 5e-145 96,4 60 72,3 97 1:1 0:0 U-->U No
GL397734.1 - - 2e-21 - - - - - - - -

Homologia (%) E i Homologia (%) G = homologia entre la query i la seqüència predita mitjançant exonerate i genewise respectivament

Espècie Scaffold Subseq Orientació (blast) e-value Homologia (%) E Score E Homologia (%) G Score G Exons Introns aa d'interès Secis
Pan troglodytes GL397290.1 14125921-101199 Forward 8e-58 77 85 93 97 1:2 0:0 U-->U No


Els resultats de la taula s'han obtingut mitjançant els programes explicats a l'apartat de materials i mètodes. Els podeu consultar en els següents fitxers:

GL397261.1 GL397263.1 GL397271.1 GL397290.1 GL397313.1 GL397317.1 GL397334.1 GL397337.1 GL397338.1 GL397375.1 GL397393.1
Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate
cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E)
Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E)
T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E)
Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise Genewise
cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G)
Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G)
T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G)
GL397457.1 GL397496.1 GL397566.1 GL397734.1
Exonerate Exonerate Exonerate Exonerate
cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E) cDNA (E)
Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E) Proteïna (E)
T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E) T-coffee (E)
Genewise Genewise Genewise Genewise
cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G) cDNA (G)
Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G) Proteïna (G)
T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G) T-coffee (G)

També podeu trobar el blast de totes les selenoproteïnes humanes a l'enllaç tBLASTn