Família SelU

La família de les SelU en humans consta de tres proteïnes, però cap d'elles conté selenocisteïna. Pertanyen a la família de les tioredoxines, tot i que se'n desconeix la funció exacta. En altres espècies, s'han identificat SelU contenint selenocisteïna i s'ha hipotetitzat que podrien actuar com un marcador biomolecular dels nivells de Seleni i, a més a més, podria tractar-se d’una selenoperoxidasa, implicada en la prevenció del dany neuronal.

L’arbre filogenètic obtingut a partir de les tres proteïnes humanes i les homòlegues predites en el genoma d’Aotus mostra que SelU2 i SelU3 són força properes filogenèticament, mentre que SelU1 es troba a major distància.

Figura 7. Arbre filogenètic de la família de selenoproteïnes SelU

SelU1

Hem trobat una proteïna homòloga a la SelU1 humana que presenta un alineament perfecte amb aquesta en l'scaffold KN997225.1 del genoma d'Aotus nancymaae. Està codificada per una seqüència de 10301 nucleòtids (176235 – 186536) i conté 5 exons i 4 introns, però cap selenocisteïna. Tampoc hem trobat cap predicció de selenoproteïna a través del programa Seblastian ni seqüència SECIS. Per tant, concloem que la proteïna SelU humana es conserva en Aotus nancymaae i segueix sense ser selenoproteïna, sinó un homòleg en cisteïna.



SelU2

Hem trobat una proteïna homòloga a SelU2 humana en l'scaffold KN992933.1 d'Aotus nancymaae, concretament en una seqüència de 10501 nucleòtids codificant en sentit positiu (615913 – 626414). L'alineament és força bo tot i que la proteïna és més curta, perdent entre 50 i 65 aminoàcids de l'inici de la proteïna humana. La proteïna predita conté 4 introns i 5 exons i tampoc presenta cap selenocisteïna. A més a més, com era d'esperar, no hem trobat una predicció amb Seblastian ni cap regió SECIS. Per tant, podem afirmar que l'estructura de SelU2 es troba en gran part conservada en Aotus nancymaae i segueix sense ser una selenoproteïna, sinó un homòleg en cisteïna.



SelU3

Per tal de trobar la proteïna homòloga a SelU3 en Aotus nancymaae, hem partit de l'únic hit generat pel BLAST, el qual es troba en l'scaffold KN992833.1. Tot i presentar un e-value acceptable (9e-31), hem extret una seqüència codificant en sentit positiu de 892 nucleòtids (233039 – 233931) que codifica per a una proteïna que presenta un alineament força dolent amb la proteïna humana. La proteïna conté 2 introns i 3 exons i hi trobem dos codons UGA però no podem associar-los a selenocisteïnes ja que poden codificar per senyals STOP. Tot i presentar un mal alineament amb la proteïna humana, la proteïna predita s’agrupa amb la SelU3 humana en l'arbre filogenètic, la qual cosa ens permet concloure que SelU3 s’ha conservat en l’espècie estudiada i segueix sent una homòlega en cisteïna.

Per tant, es conserven les tres proteïnes de la família de les SelU en Aotus nancymaae i, igual que les homòlogues humanes, tampoc contenen selenocisteïna.