SelK

La Selenoproteïna K (SelK) s'ha associat amb la degradació al reticle endoplasmàtic (ERAD) de proteïnes mal plegades. Sembla que el seu gen també conté elements funcionals de resposta a l'estrès al RE.

En el genoma d’Aotus nancymaae s’ha obtingut una proteína homologa a SelK en l’scaffold KN993977.1 que presenta un alineament molt bo amb la query. La seqüència que codifica per aquesta proteïna és de 281 nucleòtids (2079134-2078853) i va en sentit invers. El gen consta d’un sol exò en el què trobem una selenocisteïna en la mateixa posició final de l’exó que en la SelK d’Homo sapiens. Tot i que no hem trobat cap element SECIS en la regió 3’ UTR del gen i el Seblastian no ens ha fet cap predicció de selenoproteïna, creiem que la SelK segueix sent una selenoproteïna en Aotus nancymaae. De fet, seria molt estrany que aquesta espècie tingués menys de 24 selenoproteïnes, ja que el número de selenoproteïnes en els mamífers oscil·la entre 24 i 25. Creiem que si no hem trobat cap element SECIS a la regió 3’UTR és perquè en el fastasubseq no hem inclòs prou tros de l'scaffold i no perquè aquest no existeixi. Cal tenir en compte que sovint els SECIS estan separats per més de 2000 nucleòtids, i nosaltres només li hem donat 2961 nucleòtids de marge en el sentit 3’.