RESULTATS
Sps - Sphaeroforma arctica
| Queries | Tblastn | Fastafetch | Fastasubseq | Exonerate | Genewise | cDNA | Proteïnes | T-coffee | Blastp | Secis |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| A.gambiae |  |
|
|
|
|
|
|
|
|
 |
| H.sapiens | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| P.marinus | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| Resultats positius | | Resultats negatius |  | No resultats |
En aquest cas, el tblastn ha sortit significatiu tan amb la query de A.gambiae (e-value = 3-12) com amb H.sapiens (e-value = 2-17) i P.marinus (e-value = 1-16). Al realitzar l'anàlisi entre la query i el genoma amb el genewise s'obté un alineament prou bo, però com que el del exonerate sembla igual o més bo, l'hem tirat endavant. El cDNA s'ha extret i traduït correctament. En el t-coffee s'ha trobat per A.gambiae i P.marinus que la selenocisteïna s'ha alineat amb un codó stop, fet que possiblement indica que la proteïna de F.cylindrus es tracta d'una selenocisteïna. Per altra banda, en H.sapiens no s'ha alineat correctament. El resultat del blastp per a la query de A.gambiae ha surtit positiu, pel que molt probablement aquesta proteïna existirà al trobar homologia amb selenoproteïnes prèviament identificades. No obstant, per H.sapiens i P.marinus el resultat és negatiu. Finalment, aquest organisme no presenta elements SECIS en el seu genoma.