RESULTATS
Sps - Crithidia fasciculata
| Queries | Tblastn | Fastafetch | Fastasubseq | Exonerate | Genewise | cDNA | Proteïnes | T-coffee | Blastp | Secis |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| A.gambiae |  |
|
|
|
|
|
|
|
|
 |
| H.sapiens | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| P.marinus | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| Resultats positius | | Resultats negatius |  | No resultats |
En aquest cas, el tblastn ha sortit significatiu tan amb la query de A.gambiae (e-value = 4-59) com per H.sapiens (e-value = 1-68) i per P.marinus (e-value = 1-61.) Al realitzar l'anàlisi entre queries i genoma tan amb l'exonerate com amb el genewise s'obté un bon alineament. Per les queries d'A.gambiae i H.sapiens s'ha escollit el resultat de genewise, mentre que per la query de P.marinus s'ha procedit amb el resultat de l'exonerate. El cDNA s'ha extret i traduït correctament. En tots els casos, en el t-coffee s'ha trobat que la selenocisteïna s'ha alineat amb una cisteïna, fet que indica que la proteïna de C.fasciculata es tracta d'un homòleg de cisteïna. El resultat del blastp per a A.gambiae i P.marinus ha surtit positiu, pel que molt probablement aquesta proteïna existirà al trobar homologia amb selenoproteïnes prèviament identificades. En canvi, per a H.sapiens el blastp és negatiu. Aquest organisme no presenta elements SECIS en el seu genoma.