T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=93
*
 BAD AVG GOOD
*
Sps2.Perkinsus_   :  93
Cf_Contig765_su   :  93
cons              :  93

Sps2.Perkinsus_   VWDPTSLGLSKDFVLTSFSERKGXGCKVQPDQLSSFLPQIGDGNM
Cf_Contig765_su   -FDPVSLGLPAEFQLTDYTRLKGCSCKLPQPKLLALLQAVATSPG

cons               :**.****. :* **.::. ** .**:   :::*  :. .  


Sps2.Perkinsus_   LTEDSPDCSMVPV----GDGERV-LVSSTDFLSPISQDPFHQGWI
Cf_Contig765_su   QKDVGMDCSIVPLHHTNGKGEALFLVSTTDFFFPSVADPFLQGHI

cons               .: . ***:**:    *.** : ***:***: *   *** ** *


Sps2.Perkinsus_   AAANTLSDLYAVGADDINNILMILTVSMKMSPLEQTVTTKKMIEG
Cf_Contig765_su   GAANVLSDLYSMGIAHCDTMLMLLAASTDMDEDERLVTTREIMRG

cons              .***.*****::*  . :.:**:*:.* .*.  *: ***::::.*


Sps2.Perkinsus_   FNACCEEAGTKVTGGQTVFNPWPLLGGCAMATMLQSQLVTTDR-A
Cf_Contig765_su   FAERARLAATSVTGGQTVMNPWPLIGGVAMAVVSEAEMVRPAGLL

cons              *   .. *.*.*******:*****:** ***.: ::::* .    


Sps2.Perkinsus_   VPGNVIVLTKPLGTQVTGNLALWMMNEAQ-WGKVVKAGLDVETCT
Cf_Contig765_su   RAGDVLVLTKPLGCQIAMNLKQWLMRPSPLYEDVIEGHISRDEIE

cons               .*:*:******* *:: **  *:*. :  : .*::. :. :   


Sps2.Perkinsus_   RAVKMGDLSMMTLNKNGCRLMREFGALGATDVTGFGLVGHADNLA
Cf_Contig765_su   ELYNKATDSMRRLNREGARLMLKHGAHGATDVTGFGILGHANNFG

cons              .  : .  **  **::*.*** :.** *********::***:*:.


Sps2.Perkinsus_   RVQKSGAS-----IEIDTVPTIQGCKTLSMVRPNGRDYGLLEGRA
Cf_Contig765_su   AAQAVGSAPQSLCLVLDRLPMLKTAVA--ASRLMQDKYRLFEGYS

cons               .*  *::     : :* :* :: . :    *    .* *:** :


Sps2.Perkinsus_   AETSGGLLVMLRDKETAEKFIAALRAC
Cf_Contig765_su   AETSGGLLVALASREAAEA-------F

cons              ********* * .:*:**