RESULTATS
Sps - Physarum polycephalum
| Queries | Tblastn | Fastafetch | Fastasubseq | Exonerate | Genewise | cDNA | Proteïnes | T-coffee | Blastp | Secis |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| A.gambiae |  |
|
|
|
|
|
|
 |
|
|
| H.sapiens | |
 |
|
|
|
|
|
|
|
|
| P.marinus | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| Resultats positius | | Resultats negatius | | No resultats |
En aquest cas, el tblastn sols ha sortit significatiu amb la query de A.gambiae (e-value = 7-5). Per tant, ha estat la última que hem tirat endavant. Al realitzar l'anàlisi entre queries i genoma amb l'exonerate s'obté un bon alineament. Amb l'anàlisi mitjançant genewise les regions alineades han resultat ser curtes, i per això s'han escollit les regions alineades per l'exonerate. El cDNA s'ha extret i traduït correctament. El t-coffee presenta una baixa homologia i per tant no s'ha tingut en compte, tot i que la selenocisteïna de la query s'ha alineat amb una cisteïna de la proteïna de L.donovani. El resultat del blastp surt positiu ja que aquest troba una regió alineada molt llarga, tot i que la selenocisteïna no estigui alineada en una regió amb suficientment homologia. Per tant, tot i no ser selenoproteïna, aquesta s'identifica en proteïnes d' altres microorganismes Aquest organisme no presenta elements SECIS en el seu genoma.