RESULTATS
Sps - Dictyostelium fasciculatum
| Queries | Tblastn | Fastafetch | Fastasubseq | Exonerate | Genewise | cDNA | Proteïnes | T-coffee | Blastp | Secis |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| A.gambiae |  |
|
|
|
 |
|
|
|
|
:[29897,29995].png) |
| H.sapiens | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| P.marinus | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| Resultats positius | | Resultats negatius |  | No resultats |
En aquest cas, el tblastn ha sortit significatiu tant per la query de A.gambiae (e-value = 5-60) com per la d'H.sapiens (e-value = 8-47) i la de P.marinus (e-value = 8-47) Al realitzar l'anàlisi entre query i genoma amb l'exonerate s'obté un bon alineament. Amb l'anàlisi mitjançant genewise l'alineament no s'ha considerat òptim, i per això s'han escollit les regions alineades per l'exonerate. El cDNA s'ha extret i traduït correctament. En el t-coffee per les queries de A.gambiae i P.marinus la selenocisteïna s'ha alineat correctament amb el codó STOP trobat a la pauta de lectura més adequada, en una regió amb alta homologia. És per això que considerem que pot tractar-se d'una selenoproteïna. El resultat del blastp per a les queries A.gambiae i P.marinus ha sortit positiu, pel que molt probablement aquesta proteïna existirà al trobar homologia amb selenoproteïnes prèviament identificades. No obstant, el resultat de blastp per a H.sapiens ha estat negatiu. A més, per corroborar la hipòtesi, aquest organisme presenta elements SECIS en el seu genoma.