Resultats Maquinària a P. tricornutum

 


Query
Hits
significatius
E-Value
tBLASTn
Exonerate
GeneWise
T-Coffee
Proteïna
Presència
eEFsec
H. sapiens
1
9·10-98
candidat
+
Pstk
H. sapiens
1
2·10-7
candidat
-
SBP2
H. sapiens
1
9·10-15
candidat1
candidat2
-

-
SECp43
H. sapiens
2
1·10-10
9·10-4
candidat
-
SepSecS-tRNASec
H. sapiens
1
3·10-7
candidatSec
+
SPS2
H. sapiens
D. melanogaster
1

1
2·10-9

3·10-9

candidat1
candidat2
+

+

En analitzar la presència de maquinària necessària per la síntesis de selenoproteïnes, s'ha observat l'absència de Pstk, SBP2 i SECp43 en aquesta espècie. Per corroborar les prediccions, s'ha realitzat un BLASTp que es pot visualitzar prement aquí. A més, també s'ha buscat la presència de tRNAs en P. tricornotum, on s'ha trobat veure que només un dels gens codificants per tRNA de cisteïna presenten l'anticodó que reconeix TGA, codó codificant per la selenocisteïna. Tot i això, hi ha elements considerats essencials per la síntesis de tRNASecque com observem no s'han trobat en aquest organisme.