Resultats Maquinària a T. trahens

 


Query
Hits
significatius
E-Value
tBLASTn
GeneWise
T-Coffee
Proteïna
Presència
eEFsec
H. sapiens
1
2·10-101
Candidat
+
Pstk
H. sapiens
0
-
-
-
-
-
SBP2
H. sapiens
1
3·10-24
candidat
-
SECp43
H. sapiens
2
9·10-16
6·10-12
candidat1
candidat2

-

-
SepSecS-tRNASec
H. sapiens
1
5·10-120
candidat
+
SPS2
H. sapiens
1

1
2·10-68

3·10-4


candidat
+

En analitzar la presència de maquinària necessària per la síntesis de selenoproteïnes, s'ha observat l'absència de Pstk, SBP2 i Secp43 en aquesta espècie. Per corroborar les prediccions, s'ha realitzat un BLASTp que es pot visualitzar prement aquí. En aquests arxius es pot veure com aquelles proteïnes predites amb el protocol seguit, presenten prou similaritat a la maquinària descrita en d'altres espècies presents a la base de dades de NCBI. Tot i que les prediccions no corresponguin amb la proteïna real completa, la seqüència obtinguda és suficient com per obtenir un resultat positiu. A més, també s'ha buscat la presència de tRNAs en T. trahens (veure resultats) on s'ha trobat que dos dels gens codificants per tRNA de cisteïna presenten l'anticodó que reconeix TGA, codó codificant per la selenocisteïna. Tot i això, hi ha elements considerats essencials per la síntesis de tRNASecque com observem no s'han trobat en aquest organisme.