--> Selenoproteines_TR_Fep15
*/

Hyaloperonospora arabidopsidis

Query
tBLASTn extès
Hits
(e-value)
Exonerate
Localització dels exons
cDNA
Proteïna
GeneWise
TCoffee
BLASTp
eEFSec
Veure
3e-73
Veure
Veure
Veure
Veure
Veure
Exonerate

GeneWise
Exonerate

GeneWise
pstk
Veure
-
-
-
-
-
-
-
-
sbp2
Veure
-
-
-
-
-
-
-
-
SECp43
Veure
6e-18
Veure
Veure
Veure
Veure
Veure
Exonerate

GeneWise
Exonerate

GeneWise
SecS
Veure
5e-48
Veure
Veure
Veure
Veure
Veure
Exonerate

GeneWise
Exonerate

GeneWise
tRNASec
-
-
-
-
-
-
-
-



Per aquest genoma i utilitzant l'Exonerate, només hem aconseguit valors significatius amb les querys eEFSec, SECp43 i SecS. Els alineaments que hem obtingut mitjançant el TCoffee presenten valors de similiaritat força alts i, a més, quan hem dut a terme l'alineament amb els possibles motius catalítics també hem aconseguit valors de similiaritat alts en tots els resultats (veure alineament múltiple amb els motius funcionals: eEFSec, SECp43 i SecS). Això ens ha fet plantejar que totes tres proteïnes estan presents en H. arabidopsis i que possiblement siguin funcionals.

També hem realitzat el GeneWise per aquestes querys i hem obtingut valors similars als obtinguts per l'Exonerate, per tant, no els hem tingut en compte.