T-COFFEE, Version_8.99(Thu Feb 17 19:24:49 CET 2011 - Revision 594)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=82
*
 BAD AVG GOOD
*
SECp43        :  83
SECp43_RRM1   :  68
B.hom         :  87
C.mer         :  84
C.owc         :  82
E.sil         :  85
H.ara         :  87
N.gru         :  82
P.pal         :  72
P.ult         :  85
S.par         :  85
T.tra         :  83
cons          :  82

SECp43            1 MAASLWMGDLEPYMDENFISRAFATMGE-TVMSVKIIRN   38 
SECp43_RRM1       1 ---------------------------------------    0 
B.hom             1 ---------------------------------------    0 
C.mer             1 ---------------------------------------    0 
C.owc             1 MSTCLWFGDLEPSWDESFISSLFGQAGE-PVVGVKIIKN   38 
E.sil             1 -------------------------------LEVKLIRD    8 
H.ara             1 ---------------------------------------    0 
N.gru             1 AR-TLWMGDLDDSMDDEYVKKLFANDIRPSINSVKIIKD   38 
P.pal             1 T--SLYVGDLAPDVNEIMLSELFSKVGRSAVASIHVCRD   37 
P.ult             1 ---------------------------------------    0 
S.par             1 ---------------------------------------    0 
T.tra             1 -----------------------------TVVSAKIILD   10 

cons              1                                           39 


SECp43           39 RLTGIPAGYCFVEFADLATAEKCLHKINGKPLPGATPAK   77 
SECp43_RRM1       1 ---------------------------------------    0 
B.hom             1 ---------------------------------------    0 
C.mer             1 ---------------------------------------    0 
C.owc            39 RLTGGPAGYCFVDFGNSDRAVRVLHALNGAQIPGLDPSR   77 
E.sil             9 RHRGIVAGYGFIDFRNHETAQLVLDSLNGKPIEG--TSL   45 
H.ara             1 ---------------------------------------    0 
N.gru            39 RNTGKSIGYGFVEFASIEIAKAVLESYAGKPIPTL-PNK   76 
P.pal            38 SITFRSLGYAYVNFFNSIDAERALDTLNYSQIMG----R   72 
P.ult             1 --------------------------------AN--TLH    5 
S.par             1 --------------------------------AN--TPH    5 
T.tra            11 AETHGSAGYGFVEFETREGAQAAMPILQGRRVRA----L   45 

cons             40                                           78 


SECp43           78 RFKLNYATYGKQP--DNSPEYSLFVGDLTPDVDDGMLYE  114 
SECp43_RRM1       1 ---------------------SLWMGDLEPYMDENFISR   18 
B.hom             1 -FRLNFGGNSRNL--NLGDNYCLYIGDLESSVTDTQLYT   36 
C.mer             1 ------------------PNVSLYVGDLQPDVVEQNLFE   21 
C.owc            78 RFRLNLALYSGAT--RNEPEYSLFVGDLTADVTDFQLHS  114 
E.sil            46 RYRLNWGAGGKRI--EQAPEYSVFVGDLSPEVTDAELKA   82 
H.ara             1 RFRMNWGAGGRRI--ETSDDHSIFVGDLAPDVGDEVLLS   37 
N.gru            77 IYRLNWAAQNQGS---NPLFSSQPVGDLAPDVNDYMLEQ  112 
P.pal            73 PCRIMWSLRDPTK--RKSNVGNIFVKNLDKQVDNAMLFD  109 
P.ult             6 RFRMNWGAGGRRI--ETGDDHSVFVGDLAPDVSDELLLT   42 
S.par             6 RFRLNWGAGGKRL--ESMEDHSVFVGDLAGDVTDDVLFS   42 
T.tra            46 RIRINWAVQGSRRVADEDGLHSLFVGDLCKSVDDDMLHD   84 

cons             79                         : :*   : :  :    117 


SECp43          115 FFVKVYPSCRGGKVVLD-QTGVSKGYGFVKFTDELEQKR  152 
SECp43_RRM1      19 AFATMGETVMSVKIIRNRLTGIPAGYCFVEFADLATAEK   57 
B.hom            37 IFRDKYLSFCGAKIMRETGTSVSKGYGFIQFRARDEAET   75 
C.mer            22 LFSSVGPVVSVRRIMRD-EKGVSKGFGFVAFSHPDEAIK   59 
C.owc           115 FFKQLYASCKTAKVVVD-QAGTPKGFGFVRFTDSNDCLR  152 
E.sil            83 TFLGKYTSVLGAKVVTNPMTGSSKSFGFIRFGDEQERDE  121 
H.ara            38 TFNARFTSVRGAKVVMDPVTRMSKGFGFVRFGSKEEADQ   76 
N.gru           113 TFRNRYPSVRGAKVVMDPKSGISKGYGFVKFADEDDMMR  151 
P.pal           110 TFS-KFGNILSCKIEY--EKGVSKGYGYVHFETQESSDR  145 
P.ult            43 TFSTRFSSVRGAKVVIDPVTRMSKGFGFVRFGNKEEADQ   81 
S.par            43 TFSAKYASVRGAKVVLDQMSRISKGFGFVRF--------   73 
T.tra            85 AFAH-FSSLTSARVMWDVRTGTSREFGFVSFRDASDAER  122 

cons            118  *          ::        .  : :: *          156 


SECp43          153 ALTECQGAVGLGSKPVRLSVAIPKASRVKPVEYSQMYSY  191 
SECp43_RRM1      58 CLHKINGKP-LP---------------------------   68 
B.hom            76 ALKEMN---------------------------------   81 
C.mer            60 AVTEMNQRI-VGQKPIYVALAQRKDQRRA----------   87 
C.owc           153 ALLEMNGAVGCGGKPMRVSAATP----------------  175 
E.sil           122 ALTAMNGAE-CCGRPIRVAPATKR---------------  144 
H.ara            77 ALQTMNGVF-CSSRPMRVSVATER---------------   99 
N.gru           152 SMTEMQGVY-ISSRPVKISH-------------------  170 
P.pal           146 AIQGVNGTM-LCGKPITVEQFVSKVE-------------  170 
P.ult            82 ALQTMNGVY-CSSRPMRVSVATDRNGKPRSG--------  111 
S.par            74 ---------------------------------------   73 
T.tra           123 ALKTMGGTM-LGRRPIRVNRANK----------------  144 

cons            157                                          195 


SECp43          192 SYNQYYQQYQNYYAQWGYDQNTGSYSYSYPQYGYTQSTM  230 
SECp43_RRM1      69 ---------------------------------------   68 
B.hom            82 ---------------------------------------   81 
C.mer            88 ---------------------------------------   87 
C.owc           176 ---------------------------------------  175 
E.sil           145 ---------------------------------------  144 
H.ara           100 ---------------------------------------   99 
N.gru           171 ---------------------------------------  170 
P.pal           171 ---------------------------------------  170 
P.ult           112 ---GYYQQYPNY-QQSGY-QNYYGYGGYYPQY-------  138 
S.par            74 ---------------------------------------   73 
T.tra           145 ---------------------------------------  144 

cons            196                                          234 


SECp43          231 QTYEEVGDDALEDPMPQLDVTEANKEFMEQSEELYDALM  269 
SECp43_RRM1      69 ---------------------------------------   68 
B.hom            82 ---------------------------------------   81 
C.mer            88 ---------------------------------------   87 
C.owc           176 ---------------------------------------  175 
E.sil           145 ---------------------------------------  144 
H.ara           100 ---------------------------------------   99 
N.gru           171 ---------------------------------------  170 
P.pal           171 ---------------------------------------  170 
P.ult           139 ---QQV---------------------------------  141 
S.par            74 ---------------------------------------   73 
T.tra           145 ---------------------------------------  144 

cons            235                                          273 


SECp43          270 DCHWQPLDTVSSEIPAMM  287 
SECp43_RRM1      69 -----------------G   69 
B.hom            82 -----------------G   82 
C.mer            88 ---------------QIE   90 
C.owc           176 -----------------K  176 
E.sil           145 ----------------TS  146 
H.ara           100 -----------------S  100 
N.gru           171 -----------------A  171 
P.pal           171 ---------------RFK  173 
P.ult           142 ---------------GGY  144 
S.par            74 ------------------   73 
T.tra           145 -----------------K  145 

cons            274                     291