--> Selenoproteines_TR_Fep15
*/

Thecamonas trahens

Query
tBLASTn extès
Hits
(e-value)
Exonerate
Localització dels exons
cDNA
Proteïna
GeneWise
TCoffee
BLASTp
eEFSec
Veure
e-101
Veure
Veure
Veure
Veure
Veure
Exonerate

GeneWise
Exonerate

GeneWise
pstk
Veure
-
-
-
-
-
-
-
-
sbp2
Veure
3e-24
Veure
Veure
Veure
Veure
Veure
Exonerate

GeneWise
Exonerate

GeneWise
SECp43
Veure
9e-16
Veure
Veure
Veure
Veure
Veure
Exonerate

GeneWise
Exonerate

GeneWise
SecS
Veure
e-120
Veure
Veure
Veure
Veure
Veure
Exonerate

GeneWise
Exonerate

GeneWise
tRNASec
-
-
-
-
-
-
-
-
-



En aquest genoma hem observat alineaments significatius reportats per l'Exonerate per les querys eEFSec, sbp2, SECp43 i SecS. En els resultats del TCoffee hem obtingut bons alineaments entre les proteïnes extretes i les corresponents querys i, a més, les diferents proteïnes obtingudes s'alineen força bé amb els diferents motius catalítics (unió a GTP i SelB; el motiu Ribosomal-L7Ae; l'RRM i l'AAT) (veure alineament múltiple amb els motius funcionals: eEFSec, sbp2, SECp43 i SecS). Per tant, pensem que aquest genoma conté totes aquestes proteïnes funcionals. També hem executat el programa GeneWise que ens ha donat valors similars els obtinguts amb l'Exonerate.