Polysphondylium pallidum

Query	tBLASTn extès	Hits (e-value)	Exonerate	Localització dels exons	cDNA	Proteïna	GeneWise	TCoffee	BLASTp
eEFSec	Veure	e-102	Veure	Veure	Veure	Veure	Veure	Exonerate GeneWise	Exonerate GeneWise
pstk	Veure	1e-06	Veure	-	-	-	Veure	GeneWise	GeneWise
sbp2	Veure	4e-24	Veure	Veure	Veure	Veure	Veure	Exonerate GeneWise	Exonerate GeneWise
SECp43	Veure	1e-13	Veure	Veure	Veure	Veure	Veure	Exonerate GeneWise	Exonerate GeneWise
SecS	Veure	e-116	Veure	Veure	Veure	Veure	Veure	Exonerate GeneWise	Exonerate GeneWise
tRNASec	-	-	-	-	-	-	-	-	-

En aquest genoma, els alineaments realitzats mitjançant el TCoffee a partir de les proteïnes obtingudes amb l'Exonerate ens han reportat valors amb similiaritat alta per les querys d'eEFSec, sbp2, SECp43 i SecS. A més, aquestes proteïnes obtingudes també han mostrat bons alineaments amb els motius catalítics (unió a GTP i SelB; Ribosomal-L7Ae; l'RRM i l'AAT respectivament) (veure alineament múltiple amb els motius funcionals: eEFSec, sbp2, SECp43 i SecS). Aquest organisme probablement sí que presenta eEFSec, SECp43, SecS i sbp2.

El programa GeneWise ens ha donat alineaments similars als obtinguts amb l'Exonerate i, a més, també ens ha reportat un alineament per la query pstk. En aquest cas, però, tot i que mitjançant el programa Tcoffee obtenim un alineament amb un valor de similiaritat alt tan amb la query com amb el motiu catalític (trifosfat hidrolasa) (veure alineament múltiple amb els motius funcionals: pstk), no creiem que pstk es trobi present en P. pallidumja que la proteïna obtinguda és molt curta.