--> Selenoproteines_TR_Fep15
*/

Capsaspora owczarzaki

Query
tBLASTn extès
Hits
(e-value)
Exonerate
Localització dels exons
cDNA
Proteïna
GeneWise
TCoffee
BLASTp
eEFSec
Veure
2e-78
Veure
Veure
Veure
Veure
Veure
Exonerate

GeneWise
Exonerate

GeneWise
pstk
Veure
-
-
-
-
-
-
-
-
sbp2
Veure
2e-26
Veure
Veure
Veure
Veure
Veure
Exonerate

GeneWise
Exonerate

GeneWise
SECp43
Veure
5e-14
Veure
Veure
Veure
Veure
Veure
Exonerate

GeneWise
Exonerate

GeneWise
SecS
Veure
1e-78
Veure
Veure
Veure
Veure
Veure
Exonerate

GeneWise
Exonerate

GeneWise
tRNASec
-
-
-
-
-
-
-
-
-



Per aquest genoma hem obtingut resultats amb les querys eEFSec, sbp2, SECp43 i SecS. En general, els alineaments que hem obtingut mitjançant el TCoffee presenten valors de similiaritat força alts. Estudiant l'alineament amb els possibles motius catalítics, que són respectivament els dos dominis presents en eEFSec (un d'unió a GTP i l'altre SelB, homòleg del domini II d'EF-TU), el domini Ribosomal-L7Ae per sbp2, l'RRM per SECp43 i l'aspartat aminotransferasa (AAT) en el cas de SecS, hem obtingut uns alineaments prou similars com per pensar que les proteïnes obtingudes són funcionals (veure alineament múltiple amb els motius funcionals: eEFSec, sbp2, SECp43 i SecS). La proteïna extreta amb la query SECp43 és molt curta, no obstant el domini catalític sí que es manté de manera que pensem que C. owczarzaki també presenta SECp43.