Per tal de discutir els resultats obtinguts, hem estructurat cada discussió de la següent manera:
En primer lloc hem descrit d'on hem tret cada query (Homo sapiens o Myotis lucifugus) i perquè hem agafat cada scaffold. També hem comentat breument els resultats de l'exonerate, del genewise i Tcoffee així com els elements SECIS i el Seblastian que hem obtingut.
Per acabar hem fet una petita reflexió sobre els resultats que hem obtingut en cada cas i hem fet un dibuix esquemàtic de com ha de ser el gen predit.