--> Selenoproteines_TR_Fep15
*/

Ectocarpus siliculosus

Query
tBLASTn extès
Hits
(e-value)
Exonerate
Localització dels exons
cDNA
Proteïna
GeneWise
TCoffee
BLASTp
eEFSec
Veure
2e-15
Veure
Veure
Veure
Veure
Veure
Exonerate

GeneWise
Exonerate

GeneWise
pstk
Veure
-
-
-
-
-
-
-
-
sbp2
Veure
-
-
-
-
-
-
-
-
SECp43
Veure
1e-15
Veure
Veure
Veure
Veure
Veure
Exonerate

GeneWise
Exonerate

GeneWise
SecS
Veure
7e-16
Veure
Veure
Veure
Veure
Veure
Exonerate

GeneWise
Exonerate

GeneWise
tRNASec
-
-
-
-
-
-
-
-
-



Per aquest genoma només hem obtingut resultats amb les querys eEFSec, SECp43 i SecS. En els tres casos els alineaments mitjançant el TCoffee han presentat valors de similiaritat alts i, a més, les diferents proteïnes obtingudes mitjançant l'Exonerate i el Fastatranslate s'han alineat amb els motius catalítics que hem escollit (per eEFSec, els motius d'unió a GTP i els motius SelB; per SECp43, el motiu RRM i per SecS, el motiu aspartat aminotransferasa (AAT))(veure alineament múltiple amb els motius funcionals: eEFSec, SECp43 i SecS). Per tant, pensem que totes tres proteïnes es troben en E. Siliculosus i que segurament són funcionals. També hem executat el GeneWise per corroborar aquests resultats i hem obtingut valors similars.