Cryptosporidium muris
(e-value) |
|||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Per aquest genoma i utilitzant l'Exonerate, només hem aconseguit valors significatius amb la query sbp2. No obstant, la proteïna que hem obtingut es troba truncada i, per tant, tot i que l'alineament amb la query en aquesta regió és d'alta similiaritat, aquest és molt curt. La proteïna obtinguda també coincideix força amb la regió que creiem que és la que determina la funció de sbp2 (Ribosomal-L7Ae).No obstant, tot i que sigui curta pensem que C. muris pot presentar sbp2 ja que es manté el domini catalític (veure alineament múltiple amb els motius funcionals: sbp2). Per corroborar aquests fets hem realitzat el GeneWise i hem obtingut resultats semblants.
Utilitzant el GeneWise, hem obtingut resultats significatius mitjançant les querys eEFSec i SECp43. En ambdós casos, els valors de l'alineament resultant de TCoffee de les diferents proteïnes obtingudes amb la query són d'alta similiaritat i, a més, coincideixen amb les regions que hem pensat que doten de funcionalitat a eEFSec i SECp43 (unió a GTP i SelB per l'eEFSec i la regió RRM1 per la SECp43) (veure alineament múltiple amb els motius funcionals:eEFSec i SECp43). Així doncs, hem conclòs que tan eEFSec com SECp43 estan presents en C.muris i que presenten bons valors per pensar que són funcionals.