RESULTADOS

8. ANÁLISIS DE LAS REGIONES PROMOTORAS con clustalw y transfac.

1. RESULTADOS OBTENIDOS MEDIANTE CLUSTALW:

2. RESULTADOS OBTENIDOS MEDIANTE TRANSFAC:

Para el promotor del plásmido pRi2659:

Restringiendo el grupo de matrices a bacteria → no obtenemos ningún dominio.

Seleccionando el grupo de matrices de todos los organismos y sin "high quality" → obtenemos 22 dominios.

(algunos aparecen también en el pRi1724 y en el pRi8196).

transfac_graphyc pRi2659

Seleccionando el grupo de matrices de todos los organismos y "high quality" → obtenemos 3 dominios.

( HNF-3beta de rata, CDP_CR1 de humano, BR-C_Z4 de Drosophila ).

transfac_graphyc pRi2659

Para el promotor del plásmido pRi1724:

Restringiendo el grupo de matrices a bacteria → no obtenemos ningún dominio.
Seleccionando el grupo de matrices de todos los organismos y sin "high quality" → obtenemos 21 dominios (casi todos iguales a los obtenidos para el plásmido pRi2659).

transfac_graphyc pRi1724
Seleccionando el grupo de matrices de todos los organismos y "high quality" → obtenemos 3 dominios, los mismos que en el plásmido pRi2659 ( HNF-3beta de rata, CDP_CR1 de humano, BR-C_Z4 de Drosophila).

transfac_graphyc pRi1724

Para el promotor del plásmido pRi8196:

Restringiendo el grupo de matrices a bacteria → no sale nada.
Seleccionando el grupo de matrices de todos los organismos y sin "high quality" → obtenemos 16 dominios (entre ellos destacamos los de mayor puntuación: C-EBP de Xenopus, HSF de Drosophila, HSF de levadura, PAX-4a de ratón).

transfac_graphyc pRi8196
Seleccionando el grupo de matrices de todos los organismos y "high quality" → no obtenemos ningún dominio.

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