BÚSQUEDA DE SECUENCIAS PROMOTORAS

INICIO Introducción D.melanogaster D.pseudoobscura A.mellifera A.gambiae Resultados conjuntos Discusión Autores Agradecimientos
Drosophila melanogaster



Obtención de el motivo a investigar y la correspondiente matriz de pesos gracias al programa MEME.

Los identificadores de los promotores de D.melanogaster
Las secuencias de los promotores de D.melanogaster
Parámetros y resultados del MEME de los promotores de D.melanogaster
Matriz del motivo encontrado las secuencias promotoras
Localización de los genes en el cromosoma.





Una vez obtenida la matriz de los promotores de D.melanogaster ejecutamos el MATSCAN contra ellos. Corriendo este programa obtenemos archivos que se pueden reconvertir en formato GFF mediante simples ordenes como egrep y awk en la linia de comandos.
A continuación se pueden ver tanto los archivos GFF de los hits como unos gráficos de los mismos, a diferentes treshold (% de identidad).
T=50%
T=25%
T=00%

    En resumen; hemos analizado los promotores de D.melanogaster, hemos obtenido el motivo con el que trabajaremos durante casi todo el trabajo y hemos comprobado su aparición en los promotores. Todos estos resultados son identicos a aquellos subministrados por el tutor de proyecto, lo que confirma que hemos manipulado bien los datos.
  • Resultados administrados por el tutor.