Conclusions DI
La Iodothyronine deiodinase és una subfamília de deiodinase enzymes involucrats en l’activació i desactivació de les hormones tiroidees. Aquesta família està formada per tres enzim en humans i per dos en ratolins, que es diferencien en la seva expressió tissular i funció. Totes les proteïnes d’aquesta subfamília són selenoproteïnes [17].
DI1
Iodothyronine deiodinase 1 s’expressa en fetge i ronyó. Per aquesta proteïna s’ha utilitzat com a query la proteïna present en Mus musculus, on de la mateixa manera que en Homo sapiens, es tracta d’una selenoproteïna.
Hem trobat una bona homologia (e-value=4e-38) i presència de selenocisteïna; en canvi, no hem pogut trobar cap SECIS amb una puntuació prou bona com per a ser considerats. Això no vol dir que no sigui present:
Per fer la recerca de l’element SECIS es va seleccionar una regió de 9.500 pb enlloc dels 15.000 (com a la resta de casos), donat que el conting no ens permetia seleccionar una regió superior. Tot i això, aquesta regió ja la considerem bastant extensa. També podria ser que aquesta selenoproteïna s’estigui perdent en Mustela putorious furo, però no és la hipòtesi més probable,ja que la funció de l’element SECIS és la de reclutar el tRNA de la selenocisteïna; i tenint en compte que la DI1 de la fura presenta una selenocisteïna, podem deduir que l’element SECIS sí està duent a terme la seva funció.
La hipòtesi que creiem més plausible és que el programa SECISearch2.19 no deixa de proporcionar-nos una predicció, i que l’element SECIS presenti una estructura alternativa que el programa no ha estat capaç de reconèixer. Per tant, el nostre organisme també presentaria aquesta selenoproteïna.
DI2
Iodothyronine deiodinase 2 s’expressa al cor, al múscul esquelètic, sistema nerviós central, teixit adipós, tiroides i glàndula pituïtària. Per aquesta proteïna també s’ha utilitzat com a query la proteïna present en Mus musculus. Hem trobat una bona homologia (e-value = 1e-89) i presència de selenocisteïna, i en aquest cas sí hem trobat un element SECIS amb una bona puntuació (score = 29,48). Per tant, es tracta d’una selenoproteïna conservada en humà, ratolí i fura.DI3
Iodothyronine deiodinase 3 s’expressa en teixit fetal i placenta. Per aquesta proteïna s’ha utilitzat com a query la proteïna present en Homo sapiens, ja que no és present en Mus musculus. Presenta molt bona homologia (e-146), presència de selenocisteïna i també un element SECIS amb una puntuació fiable (score = 29.01). Així doncs, podem dir que es tracta d’una selenoproteïna conservada en humans i fures, però que s’ha perdut en ratolins.Tornar a l'inici de la pàgina