Discussió eEFsec

Tal i com veiem en l'alineament múltiple, la majoria d'organismes protists contenen aquesta proteïna, excepte A.taiwanensis.

Per a la obtenció d'aquesta proteïna, vam realitzar normalment el procediment explicat a materials i mètodes però ens vam trobar amb problemes a diversos organismes com són C.muris, N.gruberi, T.trahens i S.parasitica. En aquests casos, un cop realitzat l'alineament global, vam observar que no tenien un bon score. Per aquest motiu, es va optar per realitzar un genewise enlloc de l'exonerate, veient que en aquests casos, la predicció era millor.

Per demostrar, que realment, totes les proteïnes obtingudes pertanyien a la família d'aquest factor d'elongació, vam realitzar un BLASTp online. En aquest cas, vam obtenir que contenien el domini comú Sel_B d'eucariotes, i els primers hits obtinguts pertanyien a la família del eEFSec.

A continuació, podem observar l'alineament múltiple mitjançant el programa Jalview on s'observen colorejades les regions observades.

Alineament amb JALVIEW

Tornar a la taula