Selenoproteïna GPx

Query tblastn exonerate cDNA Proteïna ex t-coffee ex NCBI Genewise Proteina genw t-coffee gen NCBI gen Secis
GPx1 TGA Sec Sec
GPx2 TGA Sec Sec
GPx3 TGA Sec
GPx4 TGA Sec
GPx5 i 6 - -
GPx7 TGC Cys Cys
GPx8 TGC Cys
Llegenda de colors
Sec Selenoproteïna
Cys Homòleg en cisteïna
Altres Homòleg en algun altre aminoàcid
Maq Maquinària de síntesi

Llegenda de símbols
: Resultats significatius
: Aliniament insignificant o no obtenció de resultats
: Resultats no significatius (poden ser: errors en el programa, de predicció, o aliniaments dubtosos o amb poca homologia)

GPx1 Human


Query: GPx_1 Espècie: Homo sapiens
Tipus: Selenoproteïna
Scaffold: JH584420.1, (grup 31), subseq(857971,22654)
Posició en l'scaffold: 9972 -> 12654
Exons: 2
Longitud proteïna: 12 -> 200
Longitud query: 203
SECIS: Sí 12809-12898

GPx2 Human

Query: GPx_2
Espècie: Homo sapiens
Tipus: Selenoproteïna
Scaffold: JH584650.1, (grup 261), subseq(3156076,23046)
Posició en l'scaffold: 9999 ->13046
Exons: 3
Longitud proteïna: 188
Longitud query: 190
SECIS: No

GPx3 Human

Query: GPx_3
Espècie: Homo sapiens
Tipus: Selenoproteïna
Scaffold: JH584667.1, (grup 278), subseq(1117597,22391)
Posició en l'scaffold: 20404-9999
Exons: 5
Longitud proteïna: 218
Longitud query: 226
SECIS: No

GPx4 Human

Query: GPx_4
Espècie: Homo sapiens
Tipus: Selenoproteïna
Scaffold: JH584438.1, (grup 49), subseq(117958,21023)
Posició en l'scaffold: 13049-7605
Exons: 5
Longitud proteïna: 7 -> 167
Longitud query: 197
SECIS: No

GPx5 o 6 Human

Query: GPx5 i 6
Espècie: Homo sapiens
Tipus: Selenoproteïna
Scaffold: JH584667.1, (grup 278), subseq(1117600,22388)
Posició en l'scaffold: 12391-9999
Exons: 4
Longitud proteïna: 27 -> 217
Longitud query: 221
SECIS: No

GPx7 Human

Query: GPx_7
Espècie: Homo sapiens
Tipus: Cisteïna
Scaffold: JH584487.1, (grup 98), subseq(6073039,37594)
Posició en l'scaffold: 9939-27594
Exons: 3
Longitud proteïna: 187
Longitud query: 187
SECIS: No

GPx8 Human

Query: GPx_8
Espècie: Homo sapiens
Tipus: Cisteïna
Scaffold: JH584718.1, (grup 59), subseq(638779,25436)
Posició en l'scaffold: 15436-9999
Exons: 3
Longitud proteïna: 209
Longitud query: 209
SECIS: Sí 1829-1923