RESULTATS
SelU - Dictyostelium discoideum
| Queries | Tblastn | Fastafetch | Fastasubseq | Exonerate | Genewise | cDNA | Proteïnes | T-coffee | Blastp | Secis |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| C.elegans |  |
|
|
|
|
|
|
|
 |
|
| H.sapiens1 | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| H.sapiens2 | |
 |
|
|
|
|
|
|
|
|
| H.sapiens3 | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| Resultats positius | | Resultats negatius | | No resultats |
En aquest cas, el tblastn ha sortit significatiu tan amb la query de C.elegans (e-value = 4-7) com per H.sapiens1 (e-value = 5-12 i per H.sapiens3 (e-value = 2 -15.) Al realitzar l'anàlisi entre queries i genoma amb l'exonerate s'obté un bon alineament. Amb l'anàlisi mitjançant genewise les regions alineades han resultat ser curtes, i per això s'han escollit les regions alineades per l'exonerate. El cDNA s'ha extret i traduït correctament. En el t-coffee s'ha trobat per cada una de les queries, que la selenocisteïna s'ha alineat amb una cisteïna, fet que indica que la proteïna de D.fasciculatum es tracta d'un homòleg de cisteïna. També s'ha trobat un resultat de blastp positiu en H.sapiens1 i H.sapiens3, pel que és gairebé segur que hi ha proteïnes d'aquesta familia en altres organismes. No obstant, en C.elegans el resultat del blastp ha sigut negatiu. Aquest organisme no presenta elements SECIS en el seu genoma.