RESULTATS
SelU - Ichthyophthirius multifiliis
| Queries | Tblastn | Fastafetch | Fastasubseq | Exonerate | Genewise | cDNA | Proteïnes | T-coffee | Blastp | Secis |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| C.elegans |  |
 |
|
|
|
|
|
|
|
|
| H.sapiens1 | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| H.sapiens2 |  |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| H.sapiens3 | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| Resultats positius | | Resultats negatius | | No resultats |
Per les queries C.elegans, H.sapiens1 i H.sapiens3 el tblastn indica que no hi ha cap hit que tingui un e-value inferior a -0.0001 (aquest és el nostre límit), de manera que en aquest cas no hi ha cap alineament que sigui prou significatiu.
Tanmateix, amb la query de H.sapiens2 hem obtingut un resultat significatiu pel tblastn (e-value = 1-10). A més, amb l'exonerate i el genewise s'obté un bon alineament, d'on s'extreu el seu cDNA i la seqüència protèica. No obstant, el t-coffee mostra que la possible selenocisteïna no s'alinea amb la proteïna de I. multifiliis. No presenta, tampoc, cap resultat positiu en el blastp. Tampoc conté elements SECIS, pel que es pot concloure que no es tracta d'una selenoproteïna.