Després de la nostra cerca de selenoproteïnes hem trobat selenocisteïnes i homòlegs en cisteïna de la família SelH i SelW. En el cas de SelV, no hem trobat cap selenocisteïna ni homòleg en cisteïna. La possible explicació és que aquesta família es troba exclusivament en vertebrats i per això no la trobem en protistes. Així mateix hem comprovat la semblança d'aquesta famí de proteïnes amb SelW. Hem trobat selenoproteïnes de la família SelH en C.owczarzaki, P.tricornutum i T.trahens, les tres amb elements SECIS a la regió genòmica adjacent. Per a la família de les SelW, els nostres resultats ens mostren la pres&egrove;ncia de selenoproteïnes en E.siliculosus, P.tricornutum i T.trahens, però nomes presencia d'elements SECIS en els dos primers. Observem també la pres&egrove;ncia d'una homòloga en cisteïna en C.owczarzaki. El cas més interessant és, potser, el de P.tricornutum, organisme en el qual hem trobat dues selenocisteïnes en el domini Redox (Cys-X-X-Sec) propi d'aquesta família de selenoproteïnes, fet no contemplat en cap estudi anterior. El fet de trobar la màquinaria de les selenocisteïnes en tots els genomes, inclosos aquells on no hem trobat les nostres selenocisteïnes ni homòlegs en cisteïna, pot ser causat per la presència de selenocisteïnes que no siguin de les nostres famílies en els organismes estudiats. O bé que es tracti de proteïnes no funcionals que encara conservin la seva estructura. Això explicaria els bons resultats obtinguts en l'alineament amb el TCOFFEE.




Tornar a l'inici